More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2291 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  100 
 
 
426 aa  891    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  54.95 
 
 
406 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  52.72 
 
 
411 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  53.1 
 
 
408 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  52.58 
 
 
405 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  50 
 
 
411 aa  422  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  51 
 
 
419 aa  421  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  49.01 
 
 
406 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  49.13 
 
 
404 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  48.77 
 
 
407 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  46.52 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  46.52 
 
 
409 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  48.13 
 
 
403 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  46.51 
 
 
439 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  46.29 
 
 
412 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  45.83 
 
 
404 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  44.8 
 
 
411 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  42.99 
 
 
430 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  43.24 
 
 
412 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  43.55 
 
 
410 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  43.98 
 
 
404 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  44.58 
 
 
413 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  43.84 
 
 
427 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  40.82 
 
 
420 aa  356  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  42.51 
 
 
426 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  42.26 
 
 
426 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  42.26 
 
 
426 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  42.26 
 
 
426 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  42.26 
 
 
426 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  42.26 
 
 
426 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  42.26 
 
 
426 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  42.26 
 
 
426 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  41.77 
 
 
426 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  42.26 
 
 
426 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  42.26 
 
 
426 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  41.83 
 
 
422 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  41.23 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  41.83 
 
 
422 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  40.49 
 
 
428 aa  342  9e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  41.38 
 
 
430 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  40.39 
 
 
422 aa  333  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  40.65 
 
 
435 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  40.29 
 
 
422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  40.29 
 
 
422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  40.34 
 
 
439 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  41.18 
 
 
406 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  39.29 
 
 
454 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  39.86 
 
 
454 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  39.86 
 
 
454 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  39.86 
 
 
454 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  39.77 
 
 
455 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  50.36 
 
 
548 aa  317  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  39.95 
 
 
453 aa  315  9e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  39.09 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  39.09 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  39.09 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  37.58 
 
 
458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  38.86 
 
 
455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  37.58 
 
 
458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  39.31 
 
 
454 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  39 
 
 
461 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  39.09 
 
 
455 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  40.19 
 
 
455 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  40.14 
 
 
465 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  40.72 
 
 
462 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  39.34 
 
 
447 aa  310  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  37.83 
 
 
469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  39.81 
 
 
423 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  38.1 
 
 
494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  38.34 
 
 
471 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  39.56 
 
 
462 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  39.18 
 
 
463 aa  305  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  38.69 
 
 
438 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  37.96 
 
 
471 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  37.61 
 
 
453 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  36.46 
 
 
453 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  40.49 
 
 
418 aa  298  9e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  38.72 
 
 
458 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  37.16 
 
 
453 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  39.13 
 
 
453 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  36.68 
 
 
444 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  37.53 
 
 
452 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  38.81 
 
 
467 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  37.29 
 
 
453 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  40.19 
 
 
440 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  38.93 
 
 
464 aa  294  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  38.93 
 
 
464 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  38.93 
 
 
464 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  38.71 
 
 
476 aa  294  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  35.97 
 
 
435 aa  293  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  37.83 
 
 
450 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  40.61 
 
 
471 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  36.51 
 
 
434 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  39.13 
 
 
440 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  36.71 
 
 
442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  40.72 
 
 
442 aa  286  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  37.15 
 
 
444 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  39.04 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  38 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  39.04 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>