More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1829 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  72.01 
 
 		 453 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  71.78 
 
 		 453 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  73.41 
 
 		 453 aa  667    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2206  U32 family peptidase  97.18 
 
 		 426 aa  863    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  72.91 
 
 		 453 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  68.89 
 
 		 462 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  71.91 
 
 		 458 aa  661    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  72.01 
 
 		 453 aa  668    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  71.59 
 
 		 455 aa  668    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  71.78 
 
 		 453 aa  663    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  72.91 
 
 		 453 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  71.78 
 
 		 453 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  70.45 
 
 		 455 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  100 
 
 		 444 aa  926    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  70.16 
 
 		 455 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  72.01 
 
 		 453 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  71.78 
 
 		 453 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  72.01 
 
 		 453 aa  668    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  73.12 
 
 		 450 aa  686    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  71.14 
 
 		 455 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  84.39 
 
 		 442 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  72.5 
 
 		 453 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  71.78 
 
 		 453 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01024  protease  69.87 
 
 		 466 aa  648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  79 
 
 		 464 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  73.14 
 
 		 453 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  70.68 
 
 		 455 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  68.36 
 
 		 469 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  68.61 
 
 		 461 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  73.8 
 
 		 464 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004387  putative protease  68.53 
 
 		 466 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  73.8 
 
 		 464 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  75.23 
 
 		 453 aa  692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  93 
 
 		 453 aa  859    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  69.7 
 
 		 454 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  71.3 
 
 		 458 aa  681    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  71.53 
 
 		 454 aa  665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  72.91 
 
 		 453 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  71.53 
 
 		 454 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  81.44 
 
 		 435 aa  712    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  69.7 
 
 		 454 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  70.68 
 
 		 455 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  73.8 
 
 		 464 aa  695    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  79 
 
 		 464 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  72.5 
 
 		 453 aa  684    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  70.91 
 
 		 455 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  97.07 
 
 		 444 aa  898    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  71.53 
 
 		 454 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  72.91 
 
 		 453 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  70.81 
 
 		 465 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  70.34 
 
 		 453 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  70.48 
 
 		 447 aa  668    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2466  peptidase  68.14 
 
 		 462 aa  631  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0251  putative protease  67.93 
 
 		 466 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  63.72 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  61.49 
 
 		 494 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  61.15 
 
 		 471 aa  580  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  64 
 
 		 476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  62.5 
 
 		 440 aa  554  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  62.24 
 
 		 438 aa  551  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  61.36 
 
 		 440 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  57.51 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  61.47 
 
 		 423 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  60.42 
 
 		 452 aa  528  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  60.29 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  59.14 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  57.31 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  57.56 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  57.08 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  57.08 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  56.7 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3962  peptidase U32  59.42 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  59.24 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  57.08 
 
 		 467 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  56.59 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  56.16 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.68 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  39.54 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  37.73 
 
 		 409 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  38.99 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  37.73 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  37.15 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  39.91 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  40.15 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  37.23 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  38.65 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  37.76 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  38.62 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  40.75 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  38.14 
 
 		 439 aa  279  8e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  39 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  37.03 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  35.08 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  41.79 
 
 		 413 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  41.54 
 
 		 404 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  40.31 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  38.57 
 
 		 439 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  38.95 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  37.88 
 
 		 427 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  35.29 
 
 		 430 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>