More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3011 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  71.65 
 
 
453 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  71.65 
 
 
453 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  70.2 
 
 
453 aa  658    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  71.3 
 
 
453 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  71.52 
 
 
453 aa  690    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  87.64 
 
 
455 aa  844    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  71.52 
 
 
453 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  87.42 
 
 
455 aa  842    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  67.98 
 
 
463 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  69.27 
 
 
453 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  71.46 
 
 
450 aa  688    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  86.98 
 
 
455 aa  838    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  74.55 
 
 
447 aa  712    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  68 
 
 
462 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  71.96 
 
 
453 aa  671    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  71.65 
 
 
453 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  71.4 
 
 
458 aa  674    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01024  protease  72.27 
 
 
466 aa  680    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  90 
 
 
461 aa  877    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  70.38 
 
 
464 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  87.64 
 
 
455 aa  843    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0251  putative protease  71.83 
 
 
466 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  68.18 
 
 
442 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  87.86 
 
 
455 aa  843    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  68.87 
 
 
464 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  100 
 
 
455 aa  952    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  71.65 
 
 
453 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  71.3 
 
 
453 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  90.69 
 
 
454 aa  871    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  84.27 
 
 
469 aa  836    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  71.43 
 
 
453 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  68.87 
 
 
464 aa  674    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  71.9 
 
 
458 aa  697    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  71.3 
 
 
453 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  87.17 
 
 
454 aa  841    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  87.64 
 
 
455 aa  843    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  87.17 
 
 
454 aa  841    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  87.58 
 
 
453 aa  839    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  86.31 
 
 
454 aa  850    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  71.65 
 
 
453 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  71.65 
 
 
453 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  70.82 
 
 
464 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2466  peptidase  74.62 
 
 
462 aa  707    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  71.65 
 
 
453 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  71.08 
 
 
453 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  71.3 
 
 
453 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  87.17 
 
 
454 aa  840    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004387  putative protease  72.27 
 
 
466 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  68.87 
 
 
464 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  70.39 
 
 
444 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  85.24 
 
 
465 aa  818    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  68.71 
 
 
453 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  70.16 
 
 
444 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2206  U32 family peptidase  69.95 
 
 
426 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10791  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  64.45 
 
 
494 aa  617  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  68.95 
 
 
435 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  63.54 
 
 
471 aa  596  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  65.16 
 
 
440 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  63.09 
 
 
476 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  61.25 
 
 
440 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  61.5 
 
 
423 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  61.1 
 
 
434 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  59.73 
 
 
469 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  58.31 
 
 
471 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  61.56 
 
 
435 aa  538  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  58.88 
 
 
462 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  58.14 
 
 
438 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  57.21 
 
 
458 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  57.48 
 
 
478 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  56.98 
 
 
458 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  58.08 
 
 
452 aa  521  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3962  peptidase U32  59.51 
 
 
472 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  57.94 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  57.41 
 
 
467 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  56.42 
 
 
453 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  55.45 
 
 
433 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  40.37 
 
 
411 aa  322  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  39.46 
 
 
409 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  39.24 
 
 
409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  40.09 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  39.6 
 
 
406 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  40.19 
 
 
426 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  38.98 
 
 
420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  41.19 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  40.1 
 
 
403 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  36.34 
 
 
419 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  40.15 
 
 
412 aa  293  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  39.34 
 
 
407 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  35.67 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  38.39 
 
 
404 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  38.94 
 
 
404 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  37.87 
 
 
408 aa  277  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  35.94 
 
 
439 aa  276  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  35.14 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  39.65 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  37.05 
 
 
413 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  36.38 
 
 
430 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  37.81 
 
 
439 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  37.5 
 
 
412 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  36.27 
 
 
420 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>