More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1232 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  100 
 
 
469 aa  981    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  65.48 
 
 
476 aa  617  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  61.21 
 
 
471 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  60.09 
 
 
438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  61.06 
 
 
458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  61.06 
 
 
458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  59.91 
 
 
462 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  58.47 
 
 
450 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  60.09 
 
 
465 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  57.72 
 
 
464 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  57.72 
 
 
464 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  57.3 
 
 
442 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  57.3 
 
 
471 aa  546  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  57.72 
 
 
464 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  58.39 
 
 
478 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  58.63 
 
 
469 aa  541  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  59.73 
 
 
455 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004387  putative protease  58.94 
 
 
466 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  57.05 
 
 
453 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  59.2 
 
 
453 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  57.39 
 
 
453 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  56.93 
 
 
455 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  57.6 
 
 
458 aa  538  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  56.72 
 
 
454 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  56.72 
 
 
454 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  59.42 
 
 
454 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  56.93 
 
 
455 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  58.44 
 
 
454 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  56.93 
 
 
455 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  59.07 
 
 
453 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  59.07 
 
 
453 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  59.02 
 
 
453 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  59.02 
 
 
453 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  59.07 
 
 
453 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  56.5 
 
 
455 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  56.84 
 
 
453 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  59.02 
 
 
453 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  60.52 
 
 
464 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  58.72 
 
 
467 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  58.86 
 
 
453 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  59.07 
 
 
453 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  59.07 
 
 
453 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  59.02 
 
 
453 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  58.54 
 
 
461 aa  537  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  59.07 
 
 
453 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  59.34 
 
 
454 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  56.72 
 
 
455 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  59.07 
 
 
453 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  57.51 
 
 
444 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  56.72 
 
 
455 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  59.02 
 
 
453 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  58.76 
 
 
435 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3962  peptidase U32  60.79 
 
 
472 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  57.48 
 
 
440 aa  534  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  56.41 
 
 
447 aa  532  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2466  peptidase  58.42 
 
 
462 aa  532  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  60.3 
 
 
464 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  59.6 
 
 
432 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  56 
 
 
462 aa  529  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  59.11 
 
 
453 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01024  protease  58.24 
 
 
466 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0251  putative protease  57.78 
 
 
466 aa  531  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  54.45 
 
 
463 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  57.84 
 
 
423 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  56.51 
 
 
494 aa  528  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  56.65 
 
 
453 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  58.09 
 
 
453 aa  524  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  57.05 
 
 
453 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  57.66 
 
 
458 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2206  U32 family peptidase  56.83 
 
 
426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10791  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  57.51 
 
 
444 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  55.19 
 
 
452 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  53.65 
 
 
440 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  54.89 
 
 
435 aa  504  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  55.23 
 
 
434 aa  504  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  51.33 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  36.05 
 
 
426 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  37.07 
 
 
403 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  36.67 
 
 
405 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  35.18 
 
 
412 aa  263  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  36.58 
 
 
404 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  35.14 
 
 
407 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  34.42 
 
 
414 aa  246  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  34.29 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  34.14 
 
 
408 aa  243  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  35.39 
 
 
410 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  31.25 
 
 
420 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  31.22 
 
 
411 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  34.81 
 
 
419 aa  232  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  33.49 
 
 
420 aa  230  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  34.75 
 
 
406 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1864  peptidase U32  36.29 
 
 
430 aa  225  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  34.16 
 
 
406 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  49.5 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  34.93 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  33.98 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  33.18 
 
 
411 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  33.26 
 
 
408 aa  217  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  30.93 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  30.93 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>