More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0474 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  100 
 
 		 411 aa  839    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  47.42 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  48.16 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  45.04 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  44.8 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  46.19 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  47.65 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  44.33 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  46.4 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  43.46 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  44.34 
 
 		 430 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  45.19 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  43.63 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  42.57 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  44.2 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  44.61 
 
 		 412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  40.33 
 
 		 409 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  40.33 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  44.81 
 
 		 413 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  48.75 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  43.17 
 
 		 404 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  40.34 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  43.31 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  41.32 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  40.69 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  40.69 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  40.69 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  40.69 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  40.69 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  40.69 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  40.69 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  40.69 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  40.59 
 
 		 426 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  40.44 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  40.29 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  40.29 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  40.2 
 
 		 426 aa  309  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  39.41 
 
 		 420 aa  309  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  41.24 
 
 		 427 aa  299  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  43.39 
 
 		 406 aa  299  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  40.49 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  39.75 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  36.83 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  45.76 
 
 		 548 aa  279  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  43.06 
 
 		 418 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  36.96 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  35.77 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  36.61 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  39.27 
 
 		 471 aa  270  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  38.21 
 
 		 423 aa  269  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  34.96 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  40.17 
 
 		 442 aa  262  6.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  35.03 
 
 		 462 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  36.22 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  35.25 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  35.25 
 
 		 458 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  36.95 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  36.43 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  40.05 
 
 		 417 aa  255  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  35.7 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  35.99 
 
 		 447 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  35.82 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  39.54 
 
 		 810 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  37.47 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  35.95 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  35.62 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  35.84 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  37.44 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  43.81 
 
 		 414 aa  252  7e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  35.37 
 
 		 454 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  35.37 
 
 		 454 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  35.37 
 
 		 454 aa  252  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  35.28 
 
 		 455 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  35.48 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  35.87 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  35.26 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  35.27 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  35.58 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  34.51 
 
 		 454 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  35.04 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  35.84 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  35.04 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  35.04 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  34.41 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  36.67 
 
 		 453 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  35.45 
 
 		 440 aa  249  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  42.48 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  34.79 
 
 		 455 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  35.59 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  36.04 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  34.23 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  41.23 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  35.37 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  35.37 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  35.37 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  37.75 
 
 		 464 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  37.95 
 
 		 464 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  33.71 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  40.13 
 
 		 783 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  35.04 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>