More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0211 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  100 
 
 
435 aa  892    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  45.64 
 
 
411 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  47.56 
 
 
404 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  46.83 
 
 
406 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  48.61 
 
 
403 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  48.64 
 
 
404 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  47.07 
 
 
404 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  48.38 
 
 
439 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  45.5 
 
 
407 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  48.13 
 
 
412 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  45.82 
 
 
430 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  42.96 
 
 
406 aa  353  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  43.03 
 
 
405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  41.83 
 
 
408 aa  349  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  43.71 
 
 
419 aa  349  6e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  41.79 
 
 
420 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  46.38 
 
 
410 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  44.13 
 
 
427 aa  346  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  46.39 
 
 
413 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  42.65 
 
 
409 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  42.65 
 
 
409 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  40.65 
 
 
426 aa  333  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  40.79 
 
 
411 aa  332  8e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  40.4 
 
 
412 aa  328  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  46.47 
 
 
406 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  43.31 
 
 
411 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  38.7 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  36.69 
 
 
426 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  36.69 
 
 
426 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  36.69 
 
 
426 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  36.69 
 
 
426 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  36.69 
 
 
426 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  36.69 
 
 
426 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  36.69 
 
 
426 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  36.45 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  36.69 
 
 
426 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  36.21 
 
 
426 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  44.17 
 
 
418 aa  286  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  36.45 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  37.2 
 
 
422 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  38.41 
 
 
422 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  35.01 
 
 
422 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  35.45 
 
 
422 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  35.45 
 
 
422 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  44.21 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  44.76 
 
 
411 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  36.5 
 
 
435 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  36.99 
 
 
434 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  44.57 
 
 
548 aa  260  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  45.21 
 
 
471 aa  260  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  36.89 
 
 
428 aa  259  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  35.36 
 
 
453 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  37.2 
 
 
453 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  32.91 
 
 
494 aa  257  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  35.66 
 
 
455 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  34.97 
 
 
442 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  35.66 
 
 
454 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  35.66 
 
 
454 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  35.66 
 
 
454 aa  256  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  40.88 
 
 
455 aa  256  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  35.58 
 
 
455 aa  256  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  40.73 
 
 
408 aa  255  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  36.66 
 
 
423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  36.02 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  40.06 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  40.59 
 
 
455 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  40.59 
 
 
455 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  40.59 
 
 
455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  40.12 
 
 
454 aa  253  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  35.43 
 
 
453 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  40.29 
 
 
455 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  36.83 
 
 
444 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  35.1 
 
 
462 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  32.38 
 
 
471 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  34.56 
 
 
461 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  35.83 
 
 
430 aa  251  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  34.61 
 
 
428 aa  250  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  44.16 
 
 
783 aa  250  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  34.36 
 
 
476 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  34.89 
 
 
447 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  35.45 
 
 
440 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  34.12 
 
 
464 aa  247  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  35.6 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  34.12 
 
 
464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  34.12 
 
 
464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  34.39 
 
 
469 aa  246  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  34.93 
 
 
465 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  44 
 
 
783 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  33.74 
 
 
463 aa  246  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  33.85 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  33.63 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4499  peptidase U32  35.91 
 
 
400 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  33.83 
 
 
467 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  38.89 
 
 
414 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  42.33 
 
 
886 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  32.46 
 
 
471 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  32.14 
 
 
462 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  35.51 
 
 
464 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  33.26 
 
 
450 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  32.97 
 
 
458 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>