More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0716 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  100 
 
 		 408 aa  828    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  50.62 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3095  U32 family peptidase  49.55 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  52.22 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2645  peptidase U32  50.61 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  39.54 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  38.54 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  39.73 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  36.83 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  40.35 
 
 		 404 aa  269  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  39.22 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  40 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  41.13 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  37.47 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  40.35 
 
 		 439 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  40.79 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  42.06 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.58 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  41.67 
 
 		 406 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.18 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  39.9 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  40.73 
 
 		 435 aa  255  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  34.89 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  42.22 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  34.89 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  38.55 
 
 		 419 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  36.59 
 
 		 439 aa  249  6e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  38.24 
 
 		 405 aa  248  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  36.91 
 
 		 422 aa  249  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  37.8 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  41.25 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  39.37 
 
 		 427 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  38.28 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  37.7 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  33.74 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  33.74 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  33.74 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  33.74 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  33.74 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  33.74 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  33.74 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  37.1 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  33.25 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  33.25 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  34.99 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  33.25 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  37.84 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  32.07 
 
 		 426 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  34.99 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  36.55 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  33.99 
 
 		 422 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  39.23 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  36.02 
 
 		 434 aa  227  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  36.25 
 
 		 433 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  37.69 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  38.68 
 
 		 423 aa  223  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  37.59 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  37.18 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  35.79 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  36.22 
 
 		 453 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  35.22 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  38.24 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  33.6 
 
 		 414 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  37.09 
 
 		 464 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  34.61 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  36.13 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  33.1 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  33.1 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  33.1 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  33.02 
 
 		 455 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  36.55 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  35.6 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  40.06 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  33.33 
 
 		 462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  37.98 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  34.55 
 
 		 447 aa  216  7e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  34.35 
 
 		 455 aa  216  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  37.08 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  34.01 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  34.14 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  34.35 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  37.15 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  33.76 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  33.76 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  33.5 
 
 		 461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  33.76 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  34.59 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  33.25 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  34.15 
 
 		 494 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  33.5 
 
 		 455 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  33.91 
 
 		 471 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  35.54 
 
 		 467 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  32.48 
 
 		 454 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  38.83 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  34.1 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  35.11 
 
 		 453 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  35.46 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  33.33 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  33.76 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  33.09 
 
 		 458 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>