More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2306 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  100 
 
 		 408 aa  827    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2645  peptidase U32  70.86 
 
 		 430 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3095  U32 family peptidase  51.25 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  49.26 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  52.22 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  41.5 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  43.13 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  38.42 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  42.44 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  35.73 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  41.12 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  38.11 
 
 		 413 aa  250  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  43.13 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  37.19 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  40.4 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  41.72 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  37.83 
 
 		 430 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  40.65 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  40.65 
 
 		 409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  42.07 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  36.81 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  42.74 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  44.23 
 
 		 435 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  35.78 
 
 		 412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  39.42 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  34.22 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  41.94 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  41.23 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  38.07 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  38.48 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  37.91 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  37.03 
 
 		 464 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  39.12 
 
 		 414 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  36.26 
 
 		 464 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  41.99 
 
 		 404 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  34.01 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  37.46 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  38.39 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  42.73 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  36.86 
 
 		 411 aa  223  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  34.62 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  33.91 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  42.43 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  39.27 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  37.46 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  33.26 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  41.61 
 
 		 422 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  31.08 
 
 		 450 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  36.16 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  32.91 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  36.65 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  38.38 
 
 		 783 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  32.47 
 
 		 462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  30.49 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  30.49 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  36.87 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  30.49 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  31.41 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  36.87 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  36.87 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  36.87 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  35.41 
 
 		 471 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  36.87 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  41.61 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  36.58 
 
 		 458 aa  213  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  36.87 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  36.87 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  36.87 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  36.87 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  36.87 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  36.87 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  36.87 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  36.87 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  34.66 
 
 		 471 aa  213  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  34.89 
 
 		 476 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  36.16 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  37.2 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  40.29 
 
 		 548 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  33.66 
 
 		 440 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  33.66 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  32.8 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  38.06 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  32.55 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  34.84 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  33.17 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  32.13 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  35.99 
 
 		 455 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  36.09 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  36.09 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  36.09 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  38.14 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  38.14 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  37.5 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  31.68 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2206  U32 family peptidase  33.16 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  37.58 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  31.59 
 
 		 453 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  36.19 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  31.65 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  34.72 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>