More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2645 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2645  peptidase U32  100 
 
 		 430 aa  873    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  70.86 
 
 		 408 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3095  U32 family peptidase  53.51 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  50.74 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  50.61 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  41.06 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  39.61 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  43.04 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  37.28 
 
 		 439 aa  256  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  41.46 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  37.87 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  42 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  41.64 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  43.01 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  42.99 
 
 		 426 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  42.04 
 
 		 411 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  42.35 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  35.18 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  42.31 
 
 		 410 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  40.84 
 
 		 405 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.02 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  38.48 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.2 
 
 		 406 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  34.85 
 
 		 412 aa  235  9e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  35.86 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  35.86 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  38.46 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  40.31 
 
 		 430 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  36.21 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  40.76 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  38.22 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  38.44 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  41.84 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  41.03 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  44.57 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  36.73 
 
 		 548 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  34.9 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  40 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  35.48 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  37.97 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  33.81 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  38.76 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  37.18 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  40.89 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  38.44 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  34.22 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  34.44 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  33.01 
 
 		 471 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  35.5 
 
 		 476 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  31.94 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  31.94 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  31.94 
 
 		 464 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  34.71 
 
 		 464 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  37.7 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  32.57 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  36.01 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  32.66 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  37.7 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  37.7 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  37.7 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  37.7 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  37.7 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  37.7 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  37.7 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  37.7 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  32.63 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  36.06 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  37.01 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  35.03 
 
 		 464 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  32.01 
 
 		 462 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  37.33 
 
 		 783 aa  203  6e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  31.91 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  31.91 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  31.91 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  31.91 
 
 		 454 aa  202  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  37.38 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  37.7 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  33.33 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  35.11 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  39.94 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  34.62 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  31.84 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  31.79 
 
 		 453 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  36.54 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  35.54 
 
 		 422 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  35.54 
 
 		 422 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  31.55 
 
 		 453 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  31.75 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  31.69 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  31.75 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  31.68 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  36.15 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  31.68 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  31.68 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  41.79 
 
 		 790 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  34.99 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  31.6 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3962  peptidase U32  34.09 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  31.44 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  37.19 
 
 		 783 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>