More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3095 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3095  U32 family peptidase  100 
 
 
449 aa  917    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2645  peptidase U32  53.51 
 
 
430 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  51.25 
 
 
408 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  49.55 
 
 
408 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  47.95 
 
 
417 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  37.99 
 
 
413 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  38.37 
 
 
419 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  41.95 
 
 
404 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  32.57 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  35.18 
 
 
408 aa  236  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  30.91 
 
 
420 aa  236  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  36.49 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  32.03 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  33.73 
 
 
414 aa  233  7.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  33.92 
 
 
426 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  36.76 
 
 
411 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  37.57 
 
 
430 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  40.28 
 
 
404 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  39.88 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  35.93 
 
 
411 aa  225  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  35.73 
 
 
405 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  36.97 
 
 
406 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  32.87 
 
 
409 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.39 
 
 
406 aa  222  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  32.87 
 
 
409 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  35.33 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  35.33 
 
 
439 aa  220  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  35.78 
 
 
438 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  38.2 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  39.39 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  36.48 
 
 
427 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  33.69 
 
 
442 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  31.73 
 
 
419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  36.47 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  34.51 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  31.77 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  31.77 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  31.77 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  32.88 
 
 
453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  31.34 
 
 
455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  40.8 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  32.94 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  32.55 
 
 
453 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  31.98 
 
 
453 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  31.97 
 
 
420 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  32.77 
 
 
464 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  35.45 
 
 
462 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  31.83 
 
 
447 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  37.07 
 
 
440 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  32.77 
 
 
464 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  32.77 
 
 
464 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  34.19 
 
 
453 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  34.12 
 
 
444 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  35.17 
 
 
423 aa  209  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  31.41 
 
 
454 aa  209  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  33.24 
 
 
418 aa  209  7e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  33.26 
 
 
453 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  31.28 
 
 
455 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  33.49 
 
 
465 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  31.34 
 
 
455 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  30.77 
 
 
455 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  33.19 
 
 
453 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  30.77 
 
 
455 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  36.71 
 
 
404 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  33.6 
 
 
435 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  35.57 
 
 
423 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  30.56 
 
 
455 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  31.78 
 
 
452 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  32.49 
 
 
450 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  33.03 
 
 
432 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  30.99 
 
 
461 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  35.36 
 
 
422 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  34.19 
 
 
464 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  35.36 
 
 
422 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  33.49 
 
 
476 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  31.43 
 
 
417 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  31.65 
 
 
454 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  33.96 
 
 
434 aa  203  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  30.8 
 
 
494 aa  203  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  33.9 
 
 
464 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  33.96 
 
 
458 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  32.6 
 
 
471 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  31.71 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  36.92 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  31.5 
 
 
455 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  34.59 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  35.17 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  31.43 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  28.81 
 
 
418 aa  199  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  34.82 
 
 
467 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  34.12 
 
 
444 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  33.04 
 
 
426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  32.05 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  31.83 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  31.87 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  32.46 
 
 
426 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  32.46 
 
 
426 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  32.46 
 
 
426 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  32.46 
 
 
426 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  32.46 
 
 
426 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>