More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1005 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  83.69 
 
 		 417 aa  723    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  83.69 
 
 		 417 aa  723    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  82.97 
 
 		 417 aa  721    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  100 
 
 		 418 aa  862    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  64.27 
 
 		 420 aa  571  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  62.17 
 
 		 418 aa  553  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  58.25 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  57.73 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1864  peptidase U32  54.96 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  37.91 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  39.42 
 
 		 409 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  37.57 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  39.42 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  41.1 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  35.06 
 
 		 420 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  35.15 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  37.2 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  34.9 
 
 		 453 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  36.77 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  33.96 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  38.16 
 
 		 406 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  39.61 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  34.04 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  33.56 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  36.16 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  37.29 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  34.74 
 
 		 471 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  33.68 
 
 		 447 aa  243  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  39.54 
 
 		 412 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  36.48 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  33.33 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  33.33 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  33.33 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  36.57 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  40.93 
 
 		 548 aa  239  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  39.58 
 
 		 414 aa  239  8e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  33.17 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  35.87 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  37.61 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  38.91 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  33.49 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  39.34 
 
 		 406 aa  236  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  33.57 
 
 		 465 aa  236  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  33.01 
 
 		 455 aa  235  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  33.96 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  35.47 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  33.09 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  33.01 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  31.54 
 
 		 469 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  35.47 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  35.47 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  37.46 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  32.77 
 
 		 455 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  32.77 
 
 		 455 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  33.08 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  32.77 
 
 		 453 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  36.74 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  33.02 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  33.41 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  32.53 
 
 		 455 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  33.58 
 
 		 440 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  33.97 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  33.25 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  32.19 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  33.9 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  33.9 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  33.9 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  33.9 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  33.9 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  33.9 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  33.9 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  33.9 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  38.44 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  34.29 
 
 		 464 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  33.08 
 
 		 454 aa  229  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  32.94 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  35.54 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  33.33 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  32 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2466  peptidase  32.54 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  29.07 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  31.87 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  32.93 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  31.83 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  33.77 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  32.76 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  39.61 
 
 		 408 aa  226  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  33.41 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  33.41 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  33.41 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  33.41 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  31.54 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004387  putative protease  33.18 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  31.61 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  29.5 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  31.4 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  33.33 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  33.17 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  32.9 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  33.41 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>