More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1050 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  75.12 
 
 		 420 aa  671    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  100 
 
 		 418 aa  861    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  64.58 
 
 		 417 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  64.1 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  64.1 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  64.9 
 
 		 419 aa  559  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  62.17 
 
 		 418 aa  553  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  58.23 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1864  peptidase U32  57.31 
 
 		 430 aa  494  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  48.4 
 
 		 411 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  42.19 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  40.67 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  37.21 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  38.36 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  45.57 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  36.75 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  33.84 
 
 		 471 aa  269  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  35.7 
 
 		 450 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  36.75 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  40.73 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  46.62 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  33.76 
 
 		 458 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  33.76 
 
 		 458 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  35.84 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  35.18 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  35.18 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  46.28 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  41.49 
 
 		 435 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  40.61 
 
 		 420 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  40.33 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  45.76 
 
 		 548 aa  262  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  37.86 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  43.59 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  40.61 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  37.56 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  36.32 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  34.78 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  38.11 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  37.8 
 
 		 453 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  35.41 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  37.8 
 
 		 453 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  37.8 
 
 		 453 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  37.8 
 
 		 453 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  37.8 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  36.25 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  36.82 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  39.5 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  32.91 
 
 		 478 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  38.67 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  38.67 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  38.67 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  38.67 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  38.67 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  38.67 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  38.67 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  38.67 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  37.07 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  36.43 
 
 		 463 aa  256  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  35.27 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  36.87 
 
 		 442 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  36.07 
 
 		 454 aa  255  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  36.79 
 
 		 455 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  43.04 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  43.04 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  36.79 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  36.88 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  36.88 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  36.88 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  36.92 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  34.7 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  36.3 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  36.3 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  36.05 
 
 		 455 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  39.4 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  38.89 
 
 		 476 aa  253  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  36.12 
 
 		 453 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  42.59 
 
 		 411 aa  253  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  44.66 
 
 		 419 aa  252  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  35.25 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  35.05 
 
 		 471 aa  251  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  34.66 
 
 		 458 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  37.6 
 
 		 458 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  33.26 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2709  peptidase U32  36.56 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  35.48 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  35.23 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  36.04 
 
 		 464 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  35.7 
 
 		 461 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  36.14 
 
 		 465 aa  249  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  35.48 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  36.25 
 
 		 464 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  36.94 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  35 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  35.75 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  36.25 
 
 		 435 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  34.69 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  40 
 
 		 440 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  36.03 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  42.38 
 
 		 418 aa  242  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2466  peptidase  36.03 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>