More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0711 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  100 
 
 		 417 aa  858    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2645  peptidase U32  50.74 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  50.62 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3095  U32 family peptidase  47.95 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  49.26 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  41.21 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  36.96 
 
 		 412 aa  266  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  35.47 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  36.5 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  39.18 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  39.75 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  39.29 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  36.29 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  37.41 
 
 		 411 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  40.56 
 
 		 404 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  40.77 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  40.05 
 
 		 411 aa  255  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  40.35 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  40.2 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  38.36 
 
 		 439 aa  252  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  41.03 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  38.67 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  37.85 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  38.67 
 
 		 409 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  40.27 
 
 		 410 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  36.98 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.75 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  37.95 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  36.08 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  41.6 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  37.19 
 
 		 404 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  38.07 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  36.34 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  41.48 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  37.87 
 
 		 422 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  37.87 
 
 		 422 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  35.54 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  37.5 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  36.81 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  40.32 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  36.7 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  33.25 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  37.18 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  35.23 
 
 		 464 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  41.61 
 
 		 783 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  34.25 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  35.87 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  35 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  35.52 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  36.1 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  35.24 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  34.55 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  35.23 
 
 		 430 aa  222  8e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  35.6 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  35.6 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  35.5 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  35.5 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  35.5 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  35.5 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  35.5 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  35.5 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  35.5 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  35.05 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  35.99 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  33.33 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  34.7 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  34.43 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  34.02 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  34.85 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  32.71 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  35.65 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  33.73 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1199  peptidase U32  34.66 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0189414  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  33.73 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  33.73 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  37.91 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  35.82 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01986  predicted peptidase  33.73 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  33.73 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0605791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  33.73 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01978  hypothetical protein  33.73 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1560  peptidase U32  33.73 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  0.902837 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1575  peptidase U32  33.73 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  35.38 
 
 		 420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2375  U32 family peptidase  33.73 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1150  peptidase, U32 family  33.73 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.565411  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  32.6 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  33.89 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  32.87 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  33.89 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  33.89 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  39.13 
 
 		 548 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.33 
 
 		 836 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  33.89 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  32.6 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  33.89 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  35.14 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  33.76 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  34.91 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  34.26 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>