More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1107 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  100 
 
 		 836 aa  1712    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  42.51 
 
 		 847 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  42.15 
 
 		 848 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  42.82 
 
 		 835 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  41.39 
 
 		 862 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  41.58 
 
 		 838 aa  575  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  40.64 
 
 		 872 aa  556  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  37.78 
 
 		 886 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  39.58 
 
 		 839 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  37.49 
 
 		 810 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  36.08 
 
 		 835 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  35.66 
 
 		 783 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  34.43 
 
 		 783 aa  433  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  33.29 
 
 		 783 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  33.06 
 
 		 783 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  34.29 
 
 		 828 aa  423  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  33.84 
 
 		 839 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  31.57 
 
 		 817 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  34.05 
 
 		 852 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  34.16 
 
 		 840 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  31.32 
 
 		 826 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  34.14 
 
 		 837 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  33.54 
 
 		 835 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  33.41 
 
 		 823 aa  365  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  32.58 
 
 		 825 aa  359  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  30.62 
 
 		 878 aa  355  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  33.49 
 
 		 805 aa  347  6e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  33.09 
 
 		 835 aa  345  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  31.55 
 
 		 832 aa  342  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  31.14 
 
 		 841 aa  338  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  32.5 
 
 		 873 aa  337  5.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  31.57 
 
 		 826 aa  332  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  30.31 
 
 		 847 aa  326  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  33.11 
 
 		 767 aa  324  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  32.66 
 
 		 851 aa  323  8e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  30.85 
 
 		 833 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  29.97 
 
 		 877 aa  320  5e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  31.69 
 
 		 834 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  38.67 
 
 		 822 aa  308  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  33.33 
 
 		 790 aa  302  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  39.22 
 
 		 790 aa  301  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  31.99 
 
 		 790 aa  297  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  31.97 
 
 		 843 aa  296  9e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  33.2 
 
 		 818 aa  293  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  32.85 
 
 		 792 aa  290  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  39.8 
 
 		 792 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  39.53 
 
 		 790 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  30.01 
 
 		 722 aa  282  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  32.18 
 
 		 723 aa  280  9e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  30.94 
 
 		 716 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  42.64 
 
 		 696 aa  278  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  28.81 
 
 		 736 aa  266  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  37.57 
 
 		 419 aa  260  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  38.48 
 
 		 746 aa  256  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  27.96 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  39.89 
 
 		 406 aa  249  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.51 
 
 		 411 aa  248  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.21 
 
 		 407 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  40.22 
 
 		 412 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  41.5 
 
 		 406 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  38.38 
 
 		 404 aa  241  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  32.88 
 
 		 654 aa  241  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  32.88 
 
 		 654 aa  240  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  32.88 
 
 		 654 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  32.88 
 
 		 654 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  32.88 
 
 		 654 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  38.63 
 
 		 404 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  39.94 
 
 		 439 aa  238  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  34.8 
 
 		 667 aa  238  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  34.56 
 
 		 638 aa  235  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  40.24 
 
 		 411 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  33.27 
 
 		 653 aa  234  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  40.17 
 
 		 403 aa  234  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  34.12 
 
 		 621 aa  234  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  33.27 
 
 		 667 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  37.3 
 
 		 413 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  33.01 
 
 		 654 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  33.07 
 
 		 622 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  33.07 
 
 		 653 aa  233  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  33.07 
 
 		 653 aa  233  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  33.07 
 
 		 667 aa  232  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  34.24 
 
 		 638 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  35.6 
 
 		 638 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  33.07 
 
 		 667 aa  232  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  33.07 
 
 		 667 aa  232  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  34.51 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  34.04 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  34.82 
 
 		 638 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  35.45 
 
 		 638 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  43 
 
 		 435 aa  230  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  33.85 
 
 		 638 aa  230  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  41.67 
 
 		 404 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  35.09 
 
 		 638 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  34.5 
 
 		 641 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  32.82 
 
 		 644 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  31.31 
 
 		 653 aa  228  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  34.88 
 
 		 420 aa  228  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  40 
 
 		 409 aa  227  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  34.82 
 
 		 639 aa  227  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  40.67 
 
 		 439 aa  226  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>