More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3138 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  79.62 
 
 		 638 aa  1082    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  82.35 
 
 		 649 aa  1113    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  91.07 
 
 		 638 aa  1227    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  96.39 
 
 		 638 aa  1295    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  52.8 
 
 		 629 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  79.46 
 
 		 641 aa  1078    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  54.8 
 
 		 655 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  83.2 
 
 		 637 aa  1137    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  90.09 
 
 		 638 aa  1211    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  53.18 
 
 		 640 aa  685    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  67.47 
 
 		 667 aa  902    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  90.25 
 
 		 638 aa  1216    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  89.62 
 
 		 638 aa  1207    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  100 
 
 		 638 aa  1333    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  99.37 
 
 		 638 aa  1324    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  66.93 
 
 		 644 aa  918    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  97.34 
 
 		 638 aa  1304    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  90.25 
 
 		 638 aa  1213    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  66.93 
 
 		 639 aa  885    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  51.17 
 
 		 652 aa  626  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  50.53 
 
 		 669 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  52.29 
 
 		 667 aa  622  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  52.47 
 
 		 653 aa  609  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  52.81 
 
 		 654 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  52.31 
 
 		 667 aa  609  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  52.81 
 
 		 654 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  52.47 
 
 		 667 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  52.31 
 
 		 667 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  52.56 
 
 		 654 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  52.97 
 
 		 654 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  52.31 
 
 		 667 aa  609  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  52.31 
 
 		 653 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  52.31 
 
 		 653 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  52.15 
 
 		 653 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  52.81 
 
 		 654 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  52.65 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  50.08 
 
 		 667 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  49.76 
 
 		 666 aa  596  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  49.92 
 
 		 692 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  50.08 
 
 		 666 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  50.23 
 
 		 666 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  48.45 
 
 		 672 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4811  peptidase U32  50.08 
 
 		 668 aa  594  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0604959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  50.23 
 
 		 668 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2870  peptidase U32  50.08 
 
 		 666 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.615102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  50.23 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  48.89 
 
 		 662 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2431  peptidase U32  50 
 
 		 657 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  49.61 
 
 		 668 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  42.9 
 
 		 622 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  41.76 
 
 		 621 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  43.59 
 
 		 635 aa  482  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  35.73 
 
 		 810 aa  283  9e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  35.02 
 
 		 835 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  34.84 
 
 		 886 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.39 
 
 		 847 aa  251  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  30.96 
 
 		 783 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  31.86 
 
 		 839 aa  242  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  33.33 
 
 		 847 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  31.35 
 
 		 767 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.24 
 
 		 836 aa  232  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  30.91 
 
 		 848 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  31.43 
 
 		 723 aa  230  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  31.96 
 
 		 872 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  33.85 
 
 		 835 aa  228  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  32.09 
 
 		 783 aa  227  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  31.16 
 
 		 783 aa  226  7e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  33.15 
 
 		 838 aa  226  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  32.9 
 
 		 837 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  31.72 
 
 		 783 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  33.83 
 
 		 823 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  32.65 
 
 		 862 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  30.5 
 
 		 817 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  32.35 
 
 		 833 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  34.37 
 
 		 852 aa  218  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  33.92 
 
 		 840 aa  217  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  33.46 
 
 		 835 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  31.73 
 
 		 877 aa  212  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  32.64 
 
 		 835 aa  211  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  35.78 
 
 		 828 aa  207  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  30.8 
 
 		 841 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  29.98 
 
 		 822 aa  203  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  30.46 
 
 		 790 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  36.68 
 
 		 825 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  32.1 
 
 		 873 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  33.88 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  32.96 
 
 		 805 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  26.93 
 
 		 722 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  31.29 
 
 		 790 aa  197  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  31.44 
 
 		 851 aa  196  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  32.06 
 
 		 843 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  30.6 
 
 		 736 aa  194  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  29.9 
 
 		 792 aa  193  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  28.22 
 
 		 826 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  31.74 
 
 		 834 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  33.42 
 
 		 406 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  29.52 
 
 		 792 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  33.21 
 
 		 839 aa  191  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.75 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  29 
 
 		 826 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>