More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3797 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  89.18 
 
 
638 aa  1206    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  81.89 
 
 
649 aa  1107    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  79.94 
 
 
638 aa  1085    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  100 
 
 
638 aa  1331    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  52.64 
 
 
629 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  54.33 
 
 
655 aa  656    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  79.94 
 
 
641 aa  1081    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  89.66 
 
 
638 aa  1210    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  53.03 
 
 
640 aa  682    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  67.95 
 
 
667 aa  905    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  90.13 
 
 
638 aa  1215    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  91.54 
 
 
638 aa  1233    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  96.39 
 
 
638 aa  1295    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  96.87 
 
 
638 aa  1300    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  66.61 
 
 
644 aa  915    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  89.97 
 
 
638 aa  1214    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  97.49 
 
 
638 aa  1305    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  67.26 
 
 
639 aa  884    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  82.42 
 
 
637 aa  1126    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  50.78 
 
 
652 aa  619  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  52.29 
 
 
667 aa  621  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  49.77 
 
 
669 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  52.24 
 
 
654 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  51.99 
 
 
653 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  51.99 
 
 
653 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  51.99 
 
 
667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  52.15 
 
 
653 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  52.65 
 
 
654 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  51.99 
 
 
667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  52.15 
 
 
667 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  51.99 
 
 
667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  52.49 
 
 
654 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  51.83 
 
 
653 aa  601  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  52.49 
 
 
654 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  52.49 
 
 
654 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  52.33 
 
 
654 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  49.77 
 
 
667 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  49.61 
 
 
692 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  49.45 
 
 
666 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  49.6 
 
 
666 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  49.3 
 
 
666 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  49.77 
 
 
669 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2870  peptidase U32  49.61 
 
 
666 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.615102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  47.83 
 
 
672 aa  586  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4811  peptidase U32  49.61 
 
 
668 aa  588  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0604959  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  49.61 
 
 
668 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2431  peptidase U32  49.21 
 
 
657 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  49.3 
 
 
668 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  48.25 
 
 
662 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  41.92 
 
 
622 aa  505  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  41.73 
 
 
621 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  43.59 
 
 
635 aa  477  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  36.48 
 
 
810 aa  280  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  35.2 
 
 
835 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  34.84 
 
 
886 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  32.43 
 
 
839 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.02 
 
 
847 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  31.41 
 
 
783 aa  239  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.56 
 
 
836 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  33.15 
 
 
847 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  31.35 
 
 
767 aa  232  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  32.68 
 
 
872 aa  229  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  31.9 
 
 
723 aa  228  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  33.66 
 
 
835 aa  228  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  31.04 
 
 
848 aa  227  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  33.9 
 
 
838 aa  226  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  32.9 
 
 
837 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  34.44 
 
 
823 aa  224  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  32.46 
 
 
783 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  31.16 
 
 
783 aa  223  8e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  32.09 
 
 
783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  34.24 
 
 
852 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  33.21 
 
 
862 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  33.77 
 
 
840 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  31.17 
 
 
828 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  31.89 
 
 
833 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  30.13 
 
 
817 aa  213  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  33.46 
 
 
835 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  32.51 
 
 
835 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  31.58 
 
 
877 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  33.27 
 
 
805 aa  205  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  31.78 
 
 
790 aa  204  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  32.96 
 
 
873 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  28.2 
 
 
722 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  30.19 
 
 
841 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  33.04 
 
 
822 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  31.46 
 
 
736 aa  200  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  36.41 
 
 
825 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  31.63 
 
 
851 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  33.06 
 
 
419 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  32.08 
 
 
843 aa  195  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  29.5 
 
 
792 aa  194  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  28.22 
 
 
826 aa  193  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  31.55 
 
 
790 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  29.56 
 
 
790 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  33.42 
 
 
406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  33.9 
 
 
839 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  31.74 
 
 
834 aa  190  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  29.76 
 
 
826 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  38.03 
 
 
747 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>