More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1159 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  100 
 
 
783 aa  1604    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  41.29 
 
 
832 aa  555  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  41.89 
 
 
839 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  39.79 
 
 
873 aa  542  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  40.41 
 
 
805 aa  484  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  36.69 
 
 
835 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  35.4 
 
 
847 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.43 
 
 
836 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  33.22 
 
 
886 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  37.42 
 
 
810 aa  431  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  36.39 
 
 
834 aa  429  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  34.23 
 
 
848 aa  426  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  33.52 
 
 
862 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  34.31 
 
 
838 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  33.17 
 
 
783 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  33.42 
 
 
783 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  34.04 
 
 
839 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  34.02 
 
 
783 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  31.58 
 
 
872 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  31.2 
 
 
835 aa  344  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  30.76 
 
 
835 aa  339  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  31.18 
 
 
837 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  31.5 
 
 
852 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  31.3 
 
 
823 aa  329  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  30.55 
 
 
877 aa  327  4.0000000000000003e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  31.65 
 
 
828 aa  325  2e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  32.19 
 
 
825 aa  323  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  28.97 
 
 
835 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  28.91 
 
 
826 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  30.48 
 
 
767 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  31.67 
 
 
833 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  32.01 
 
 
840 aa  304  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  37.43 
 
 
851 aa  301  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  35.04 
 
 
817 aa  301  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  29.33 
 
 
826 aa  293  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  28.98 
 
 
841 aa  290  8e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  29.2 
 
 
878 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  30.35 
 
 
847 aa  282  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  29.96 
 
 
843 aa  278  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  34.81 
 
 
790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  39.28 
 
 
404 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  43.23 
 
 
411 aa  264  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  35.71 
 
 
790 aa  260  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  29.47 
 
 
723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  33.72 
 
 
792 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  42.33 
 
 
411 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  34.99 
 
 
792 aa  254  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  41.37 
 
 
419 aa  253  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  40.35 
 
 
406 aa  253  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  42.48 
 
 
430 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  34.35 
 
 
790 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  34.63 
 
 
790 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  37.05 
 
 
818 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  34.34 
 
 
822 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  39.59 
 
 
407 aa  251  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  41.27 
 
 
410 aa  251  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  44.16 
 
 
435 aa  250  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  29.91 
 
 
716 aa  249  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  41.42 
 
 
409 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  41.1 
 
 
409 aa  247  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0957  collagenase-like protease  43.43 
 
 
643 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0908875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  42.67 
 
 
404 aa  244  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  31.26 
 
 
736 aa  244  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  38.94 
 
 
405 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  35.51 
 
 
629 aa  241  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  42.73 
 
 
696 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  28.49 
 
 
722 aa  241  5e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  44.28 
 
 
667 aa  241  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  41.04 
 
 
403 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  37.1 
 
 
406 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  43.04 
 
 
404 aa  239  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  41.56 
 
 
413 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  38.79 
 
 
426 aa  238  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  33.39 
 
 
635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  38.61 
 
 
411 aa  237  7e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  42.16 
 
 
439 aa  236  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  39.6 
 
 
427 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  38.24 
 
 
408 aa  235  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  39.41 
 
 
422 aa  234  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  30.86 
 
 
654 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  35.73 
 
 
746 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  31.34 
 
 
654 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  30.03 
 
 
667 aa  230  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  30.03 
 
 
667 aa  230  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  30.03 
 
 
667 aa  230  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  30.03 
 
 
653 aa  230  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  30.86 
 
 
654 aa  230  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  30.03 
 
 
653 aa  230  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  30.86 
 
 
654 aa  230  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  41.5 
 
 
412 aa  230  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  30.86 
 
 
654 aa  230  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  30.86 
 
 
654 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  29.88 
 
 
653 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  37.83 
 
 
420 aa  229  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  38.28 
 
 
439 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  29.88 
 
 
667 aa  229  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  29.57 
 
 
653 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  31.61 
 
 
638 aa  227  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  31.16 
 
 
638 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  30.03 
 
 
644 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>