More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0949 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  51.96 
 
 
655 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  79.3 
 
 
638 aa  1080    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  79.94 
 
 
638 aa  1081    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  52.17 
 
 
629 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  78.52 
 
 
649 aa  1075    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  91.84 
 
 
638 aa  1239    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  53.14 
 
 
640 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  66.18 
 
 
667 aa  889    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  78.83 
 
 
638 aa  1077    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  78.83 
 
 
638 aa  1076    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  79.46 
 
 
638 aa  1078    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  79.62 
 
 
638 aa  1080    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  80.53 
 
 
637 aa  1083    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  65.83 
 
 
644 aa  905    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  100 
 
 
641 aa  1337    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  80.09 
 
 
638 aa  1079    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  79.62 
 
 
638 aa  1078    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  63.24 
 
 
639 aa  842    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  79.15 
 
 
638 aa  1078    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  50.16 
 
 
652 aa  608  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  50.79 
 
 
667 aa  611  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  49.85 
 
 
669 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  49.38 
 
 
667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  49.53 
 
 
692 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  50.71 
 
 
667 aa  592  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  50.71 
 
 
667 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  50.71 
 
 
667 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  50.47 
 
 
654 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  50.96 
 
 
653 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  50.96 
 
 
653 aa  591  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  50.71 
 
 
667 aa  592  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  50.8 
 
 
654 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  50.96 
 
 
653 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  50.8 
 
 
653 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  50.64 
 
 
654 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  50.48 
 
 
654 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  50.64 
 
 
654 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  48.06 
 
 
672 aa  588  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  50.8 
 
 
654 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4811  peptidase U32  49.07 
 
 
668 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0604959  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  48.66 
 
 
666 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  48.66 
 
 
666 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  48.5 
 
 
668 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  49.13 
 
 
668 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  48.97 
 
 
669 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  48.24 
 
 
666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  47.44 
 
 
662 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2870  peptidase U32  48.34 
 
 
666 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.615102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2431  peptidase U32  48.33 
 
 
657 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  42.23 
 
 
622 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  43.53 
 
 
635 aa  474  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  40.84 
 
 
621 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  35.61 
 
 
810 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  33.33 
 
 
835 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  33.14 
 
 
886 aa  246  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  33.33 
 
 
839 aa  239  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  32.77 
 
 
847 aa  233  8.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  31.33 
 
 
847 aa  233  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  32.93 
 
 
852 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.5 
 
 
836 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  31.31 
 
 
767 aa  228  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  31.76 
 
 
837 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  30.84 
 
 
848 aa  227  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  31.58 
 
 
817 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  32.13 
 
 
835 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  37.39 
 
 
783 aa  223  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  30.43 
 
 
723 aa  222  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  34.38 
 
 
835 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  31.29 
 
 
872 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  33.27 
 
 
862 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  30.72 
 
 
783 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  31.31 
 
 
783 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  31.12 
 
 
783 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  33.4 
 
 
823 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  32.5 
 
 
838 aa  213  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  31.68 
 
 
877 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  32.54 
 
 
873 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  30.8 
 
 
841 aa  207  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  38.22 
 
 
840 aa  206  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  30.52 
 
 
833 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  30.02 
 
 
826 aa  204  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  31.68 
 
 
839 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  35.71 
 
 
828 aa  201  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  31.17 
 
 
835 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  31.76 
 
 
843 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  39.85 
 
 
407 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  38.07 
 
 
406 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  36.64 
 
 
825 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  38.35 
 
 
419 aa  194  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  31.37 
 
 
851 aa  193  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  41.03 
 
 
790 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  32.17 
 
 
834 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  29.71 
 
 
736 aa  192  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  34.9 
 
 
822 aa  191  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  40.37 
 
 
404 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  38.36 
 
 
747 aa  190  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  30.9 
 
 
832 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  38.08 
 
 
748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  37.91 
 
 
746 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  27.95 
 
 
722 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>