More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0664 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  100 
 
 
696 aa  1421    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  44.82 
 
 
792 aa  336  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  44.44 
 
 
790 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  44.85 
 
 
792 aa  334  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  44.33 
 
 
822 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  43.97 
 
 
818 aa  320  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  43.58 
 
 
790 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  43.59 
 
 
790 aa  313  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  43.21 
 
 
790 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  29.54 
 
 
746 aa  306  7e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  42.17 
 
 
847 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  42.64 
 
 
836 aa  278  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  41.01 
 
 
810 aa  269  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  41.16 
 
 
835 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  39.64 
 
 
886 aa  263  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  38.67 
 
 
872 aa  262  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  39.29 
 
 
783 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  36.98 
 
 
839 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  40.97 
 
 
838 aa  251  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  40.1 
 
 
862 aa  250  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  37.76 
 
 
848 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  42.73 
 
 
783 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  33.18 
 
 
656 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  38.25 
 
 
783 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  37.81 
 
 
783 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  30.76 
 
 
656 aa  232  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  33.57 
 
 
817 aa  231  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  32.41 
 
 
709 aa  231  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  36.76 
 
 
407 aa  229  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  30.97 
 
 
697 aa  229  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  36.99 
 
 
828 aa  227  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  45.91 
 
 
835 aa  227  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  39.75 
 
 
767 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  41.02 
 
 
834 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  39.6 
 
 
852 aa  223  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  37.53 
 
 
823 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  43.19 
 
 
805 aa  221  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  38.33 
 
 
837 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  43.92 
 
 
716 aa  217  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  39.23 
 
 
835 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  40.27 
 
 
873 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  34.33 
 
 
722 aa  212  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  39.47 
 
 
841 aa  213  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  34.96 
 
 
409 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  36.05 
 
 
840 aa  211  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  44.95 
 
 
839 aa  211  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  44.08 
 
 
832 aa  210  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  36.26 
 
 
826 aa  210  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  34.96 
 
 
409 aa  210  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  39.2 
 
 
404 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  35.01 
 
 
406 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  36.41 
 
 
878 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  37.11 
 
 
877 aa  209  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  40.15 
 
 
411 aa  209  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  27.93 
 
 
746 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  33.59 
 
 
419 aa  207  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  39.94 
 
 
851 aa  206  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  35.14 
 
 
403 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  34.9 
 
 
723 aa  204  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  37.1 
 
 
833 aa  203  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  32.16 
 
 
426 aa  203  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  43.03 
 
 
654 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  34.18 
 
 
404 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  36.89 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  45.69 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  39.06 
 
 
847 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  37.46 
 
 
430 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  41.6 
 
 
826 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  37.61 
 
 
748 aa  200  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  39.55 
 
 
667 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  31.77 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  36.26 
 
 
410 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2306  peptidase U32  39.14 
 
 
408 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  39.64 
 
 
471 aa  192  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  34.28 
 
 
422 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  35.2 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  39.76 
 
 
835 aa  190  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  36.57 
 
 
428 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  35.43 
 
 
413 aa  190  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  32.18 
 
 
428 aa  190  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  36.21 
 
 
411 aa  190  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  32.5 
 
 
405 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  33.33 
 
 
825 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  41.73 
 
 
805 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  31.27 
 
 
411 aa  188  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  31.07 
 
 
406 aa  188  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  43.19 
 
 
748 aa  188  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  38.66 
 
 
422 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  38.55 
 
 
843 aa  187  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  26.09 
 
 
747 aa  187  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  36.91 
 
 
427 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  40.54 
 
 
655 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  38.32 
 
 
418 aa  184  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  40.15 
 
 
439 aa  183  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  36.9 
 
 
548 aa  183  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  33.53 
 
 
439 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  35.67 
 
 
412 aa  183  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  37.31 
 
 
430 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  33.33 
 
 
635 aa  182  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1155  hypothetical protein  36.27 
 
 
783 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>