More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2502 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1155  hypothetical protein  51.72 
 
 		 783 aa  778    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  53.96 
 
 		 757 aa  829    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  100 
 
 		 746 aa  1545    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  52.61 
 
 		 747 aa  816    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  49.69 
 
 		 805 aa  793    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  52.61 
 
 		 746 aa  784    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  52.95 
 
 		 748 aa  822    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  60.16 
 
 		 663 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  60.27 
 
 		 663 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  28.63 
 
 		 783 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  28.4 
 
 		 835 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  34.95 
 
 		 790 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  42.35 
 
 		 767 aa  226  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  27.66 
 
 		 835 aa  223  9e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  29.94 
 
 		 862 aa  222  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  35.54 
 
 		 792 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  38.3 
 
 		 810 aa  221  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  32.64 
 
 		 839 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  39.93 
 
 		 838 aa  220  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  38.64 
 
 		 886 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  36.94 
 
 		 847 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  34.29 
 
 		 822 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  26.49 
 
 		 823 aa  217  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  36.89 
 
 		 828 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  39.51 
 
 		 818 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  33.09 
 
 		 790 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  26.68 
 
 		 836 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  25.25 
 
 		 835 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  33.33 
 
 		 792 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  38.08 
 
 		 826 aa  212  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  32.59 
 
 		 790 aa  211  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  39.05 
 
 		 783 aa  210  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  39.05 
 
 		 783 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  33.82 
 
 		 872 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  27.93 
 
 		 696 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  35.47 
 
 		 783 aa  208  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  32.77 
 
 		 790 aa  208  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  37.22 
 
 		 825 aa  207  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  36.26 
 
 		 817 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  28.79 
 
 		 835 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  34.49 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  30.94 
 
 		 407 aa  195  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  38.26 
 
 		 848 aa  193  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  38.41 
 
 		 723 aa  192  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  35.17 
 
 		 840 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  36.93 
 
 		 832 aa  191  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  34.28 
 
 		 406 aa  191  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  28.39 
 
 		 736 aa  190  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  31.5 
 
 		 672 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  35.38 
 
 		 839 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.39 
 
 		 406 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  36.75 
 
 		 878 aa  187  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  33.05 
 
 		 411 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  33.99 
 
 		 851 aa  187  6e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  33.14 
 
 		 669 aa  187  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  37.06 
 
 		 716 aa  187  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  32.8 
 
 		 852 aa  187  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  35.71 
 
 		 877 aa  187  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  35.78 
 
 		 667 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  33.15 
 
 		 667 aa  185  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  35.87 
 
 		 653 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  35.87 
 
 		 667 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  32.48 
 
 		 420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  35.44 
 
 		 722 aa  184  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  36 
 
 		 667 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  36 
 
 		 667 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  36 
 
 		 667 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  36 
 
 		 653 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  38.11 
 
 		 746 aa  183  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  36 
 
 		 653 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  36.53 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  33.98 
 
 		 837 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  36.53 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  36.53 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  36.53 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  36.53 
 
 		 654 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  35.69 
 
 		 653 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  34.98 
 
 		 404 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  34.15 
 
 		 644 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  38.35 
 
 		 638 aa  180  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  34.53 
 
 		 413 aa  180  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  33.04 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  32.01 
 
 		 692 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  33.85 
 
 		 638 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  33.85 
 
 		 638 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  38.35 
 
 		 638 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  32.01 
 
 		 667 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  34.02 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  34.32 
 
 		 439 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  36.14 
 
 		 668 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  34.75 
 
 		 666 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  35.97 
 
 		 649 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  34.59 
 
 		 406 aa  178  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  35.31 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  34.75 
 
 		 666 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  33.53 
 
 		 419 aa  177  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  37.22 
 
 		 668 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  35.6 
 
 		 638 aa  177  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  34.75 
 
 		 638 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  39.62 
 
 		 639 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>