More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001056 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  100 
 
 		 663 aa  1385    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  88.08 
 
 		 663 aa  1217    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  60.16 
 
 		 746 aa  492  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  62.1 
 
 		 805 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  58.97 
 
 		 747 aa  425  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  58.15 
 
 		 748 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  57.71 
 
 		 757 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  55.11 
 
 		 746 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1155  hypothetical protein  57.1 
 
 		 783 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  38.24 
 
 		 839 aa  231  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  39.42 
 
 		 783 aa  230  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  42.02 
 
 		 767 aa  230  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  42.66 
 
 		 822 aa  226  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  36.86 
 
 		 783 aa  226  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  43.68 
 
 		 792 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  41.04 
 
 		 810 aa  225  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  39.53 
 
 		 862 aa  224  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  43.36 
 
 		 790 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  36.21 
 
 		 828 aa  221  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  42.97 
 
 		 792 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  37.93 
 
 		 886 aa  220  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  42.58 
 
 		 790 aa  221  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  43.36 
 
 		 818 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  42.19 
 
 		 790 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  42.97 
 
 		 790 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  41.61 
 
 		 835 aa  218  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  36.15 
 
 		 838 aa  218  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  41.28 
 
 		 823 aa  217  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  37.58 
 
 		 783 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  37.58 
 
 		 783 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  35.91 
 
 		 872 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  37.38 
 
 		 847 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  42.91 
 
 		 825 aa  211  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  39.87 
 
 		 835 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  38.93 
 
 		 835 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  37.95 
 
 		 848 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  36.33 
 
 		 826 aa  206  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  37.07 
 
 		 839 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  38.73 
 
 		 835 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  37.91 
 
 		 878 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  37.29 
 
 		 851 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  36.45 
 
 		 832 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  37.79 
 
 		 840 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.53 
 
 		 836 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  37.63 
 
 		 716 aa  195  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  35.13 
 
 		 817 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  36.79 
 
 		 837 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  34.63 
 
 		 411 aa  193  7e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.53 
 
 		 406 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  36.65 
 
 		 667 aa  193  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  35.26 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  38.26 
 
 		 696 aa  193  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  35.26 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  39.2 
 
 		 877 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  35.76 
 
 		 653 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  35.76 
 
 		 653 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  35.76 
 
 		 667 aa  191  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  35.76 
 
 		 667 aa  191  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  35.76 
 
 		 667 aa  191  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  35.76 
 
 		 667 aa  191  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  35.76 
 
 		 653 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  39.77 
 
 		 746 aa  190  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  35.44 
 
 		 653 aa  189  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  37.87 
 
 		 668 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  38.03 
 
 		 668 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  35.74 
 
 		 644 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  36.39 
 
 		 406 aa  188  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  32.95 
 
 		 404 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  36.18 
 
 		 413 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  35.64 
 
 		 722 aa  186  8e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  33.23 
 
 		 439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  35.86 
 
 		 403 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  35.05 
 
 		 655 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  35.52 
 
 		 736 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  35.56 
 
 		 654 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  34.33 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  33.54 
 
 		 412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  35.56 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  35.56 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  35.56 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  35.56 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  38.64 
 
 		 666 aa  185  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  33.44 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  35.82 
 
 		 852 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  37.25 
 
 		 873 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  32.95 
 
 		 411 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  34.58 
 
 		 669 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  33.64 
 
 		 672 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  35.97 
 
 		 404 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  34.82 
 
 		 638 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  34.82 
 
 		 638 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  34.82 
 
 		 638 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  34.76 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  39.66 
 
 		 843 aa  182  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  32 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  33.66 
 
 		 404 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  33.86 
 
 		 640 aa  181  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  36.4 
 
 		 669 aa  181  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  36.33 
 
 		 637 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  35.83 
 
 		 629 aa  181  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>