More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0024 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  67.3 
 
 		 790 aa  1088    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  52.41 
 
 		 818 aa  816    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  52.46 
 
 		 790 aa  800    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  67.39 
 
 		 790 aa  1070    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  68.96 
 
 		 792 aa  1142    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  69.52 
 
 		 790 aa  1151    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  100 
 
 		 792 aa  1629    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  57.3 
 
 		 822 aa  931    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  44.85 
 
 		 696 aa  334  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.1 
 
 		 847 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  39.73 
 
 		 746 aa  304  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  31.95 
 
 		 783 aa  300  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  36.68 
 
 		 810 aa  298  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  38.26 
 
 		 862 aa  298  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  31.79 
 
 		 872 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.85 
 
 		 836 aa  290  9e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  31.53 
 
 		 835 aa  287  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  36.59 
 
 		 848 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  32.16 
 
 		 835 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  31.51 
 
 		 839 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  33.96 
 
 		 783 aa  282  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  33.96 
 
 		 783 aa  282  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  35.85 
 
 		 886 aa  280  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  37.76 
 
 		 838 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  28.98 
 
 		 817 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  31.04 
 
 		 823 aa  259  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  42.49 
 
 		 767 aa  257  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  33.72 
 
 		 783 aa  254  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  34.29 
 
 		 837 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  32.77 
 
 		 826 aa  252  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  33.4 
 
 		 877 aa  247  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  30.43 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  28.87 
 
 		 878 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  37.88 
 
 		 839 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  36.07 
 
 		 873 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  32.86 
 
 		 835 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  33.59 
 
 		 852 aa  241  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  34.95 
 
 		 805 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  32.05 
 
 		 828 aa  232  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  31.9 
 
 		 826 aa  230  8e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  34.12 
 
 		 840 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  32.9 
 
 		 825 aa  227  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  40.34 
 
 		 656 aa  227  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  31.19 
 
 		 736 aa  226  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  28.4 
 
 		 834 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  37.67 
 
 		 407 aa  225  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  36.8 
 
 		 404 aa  225  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  35.81 
 
 		 411 aa  223  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  42.81 
 
 		 832 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  35.54 
 
 		 746 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  31.54 
 
 		 841 aa  221  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  32.12 
 
 		 851 aa  220  7e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  33.09 
 
 		 833 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  28.31 
 
 		 716 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  40.69 
 
 		 805 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  34.85 
 
 		 419 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  31.51 
 
 		 835 aa  215  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.78 
 
 		 411 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  35.81 
 
 		 413 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  38.78 
 
 		 697 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  36.71 
 
 		 656 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  42.91 
 
 		 435 aa  211  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  44.14 
 
 		 663 aa  211  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  37.43 
 
 		 709 aa  210  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  42.07 
 
 		 430 aa  210  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  30.98 
 
 		 847 aa  209  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  28.91 
 
 		 722 aa  208  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  39.19 
 
 		 548 aa  208  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  35.96 
 
 		 409 aa  208  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  36.34 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  39.59 
 
 		 654 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  41 
 
 		 748 aa  208  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  37.78 
 
 		 403 aa  207  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  43.75 
 
 		 663 aa  207  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  35.1 
 
 		 420 aa  207  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  35.96 
 
 		 409 aa  207  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.53 
 
 		 406 aa  206  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0957  collagenase-like protease  42.47 
 
 		 643 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0908875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  44.92 
 
 		 757 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  31.02 
 
 		 843 aa  203  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  38.08 
 
 		 411 aa  203  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  30.59 
 
 		 621 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  42.22 
 
 		 422 aa  202  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  35.46 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  41.85 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  40.69 
 
 		 747 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  33.97 
 
 		 428 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  30.43 
 
 		 622 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  39.34 
 
 		 439 aa  198  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  35.98 
 
 		 748 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  30.19 
 
 		 639 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  30.31 
 
 		 649 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  43 
 
 		 746 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  30.08 
 
 		 638 aa  197  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  33.71 
 
 		 408 aa  197  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  29.89 
 
 		 638 aa  197  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  30.75 
 
 		 637 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  36.78 
 
 		 667 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  36.78 
 
 		 667 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  35.24 
 
 		 404 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>