More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1511 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  100 
 
 
886 aa  1800    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  47.05 
 
 
810 aa  778    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  42.76 
 
 
835 aa  625  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  39.15 
 
 
847 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  39.8 
 
 
848 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  39.15 
 
 
838 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  37.78 
 
 
836 aa  543  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  37.4 
 
 
862 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  37.17 
 
 
839 aa  538  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  37.33 
 
 
872 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  36.74 
 
 
783 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  36.85 
 
 
783 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  34.21 
 
 
835 aa  456  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  33.22 
 
 
783 aa  431  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  31.91 
 
 
826 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  34.02 
 
 
878 aa  412  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  33.7 
 
 
839 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  31.25 
 
 
837 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  30.83 
 
 
852 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  41.28 
 
 
817 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  41.6 
 
 
783 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  31.7 
 
 
832 aa  371  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  31.36 
 
 
873 aa  360  8e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  30.57 
 
 
841 aa  360  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  31.89 
 
 
835 aa  359  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  32.12 
 
 
840 aa  354  2.9999999999999997e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  30.07 
 
 
835 aa  345  2e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  40.54 
 
 
723 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  39.58 
 
 
767 aa  337  7.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  39.34 
 
 
823 aa  335  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  32.66 
 
 
834 aa  335  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  30.08 
 
 
851 aa  325  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  36.11 
 
 
828 aa  323  8e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  40.15 
 
 
805 aa  322  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  36.64 
 
 
877 aa  316  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  35.69 
 
 
722 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  35.24 
 
 
825 aa  303  9e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  35.38 
 
 
826 aa  303  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  37.96 
 
 
790 aa  298  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  36.64 
 
 
833 aa  297  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  35.94 
 
 
716 aa  297  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  35.98 
 
 
822 aa  296  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  35.18 
 
 
847 aa  295  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  29.62 
 
 
843 aa  294  6e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  35.85 
 
 
792 aa  280  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  37.38 
 
 
790 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  36.77 
 
 
792 aa  279  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  36.14 
 
 
790 aa  279  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  34.79 
 
 
818 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  34.54 
 
 
736 aa  277  5e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  46.03 
 
 
746 aa  277  8e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  35.48 
 
 
655 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  36.96 
 
 
790 aa  273  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  34.73 
 
 
622 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  33.83 
 
 
629 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  43.2 
 
 
411 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  40 
 
 
404 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  39.47 
 
 
407 aa  264  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  34.82 
 
 
639 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  35.24 
 
 
637 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  39.64 
 
 
696 aa  263  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  45.1 
 
 
404 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  28.06 
 
 
876 aa  262  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  34.59 
 
 
621 aa  260  9e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  44.22 
 
 
419 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  34.33 
 
 
652 aa  259  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  34.32 
 
 
669 aa  259  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  43.97 
 
 
411 aa  259  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  34.84 
 
 
638 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  35.03 
 
 
638 aa  257  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  34.39 
 
 
667 aa  256  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  40.79 
 
 
422 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  34.65 
 
 
638 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  34.46 
 
 
649 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  33.84 
 
 
638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  34.84 
 
 
638 aa  255  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  43.56 
 
 
403 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  33.96 
 
 
672 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  33.4 
 
 
640 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  34.52 
 
 
667 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  43.89 
 
 
404 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  43.79 
 
 
439 aa  253  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  39.5 
 
 
406 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  33.08 
 
 
653 aa  251  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  39.77 
 
 
422 aa  251  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  42.48 
 
 
410 aa  251  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  32.53 
 
 
653 aa  250  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  32.28 
 
 
654 aa  250  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  32.53 
 
 
667 aa  250  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  32.53 
 
 
653 aa  250  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  32.53 
 
 
653 aa  250  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  32.28 
 
 
654 aa  250  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  32.28 
 
 
654 aa  250  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  34.35 
 
 
635 aa  249  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  32.53 
 
 
667 aa  250  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  32.53 
 
 
667 aa  250  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  32.53 
 
 
667 aa  250  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  32.09 
 
 
654 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  40.26 
 
 
409 aa  249  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  43.14 
 
 
412 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>