More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0327 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  52.15 
 
 
654 aa  655    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  50.99 
 
 
748 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  48.78 
 
 
656 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  100 
 
 
656 aa  1340    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  53.32 
 
 
709 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  53.08 
 
 
697 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0024  peptidase U32  44.84 
 
 
754 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  41.42 
 
 
822 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  30.76 
 
 
696 aa  232  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  40.34 
 
 
792 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  38.07 
 
 
790 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  37.53 
 
 
792 aa  219  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  40.76 
 
 
818 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  41.19 
 
 
746 aa  211  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  36.59 
 
 
790 aa  207  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  37.99 
 
 
790 aa  206  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  38.17 
 
 
790 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  39 
 
 
886 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  35.42 
 
 
837 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  38.95 
 
 
548 aa  178  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  33.88 
 
 
872 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  35.54 
 
 
847 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  35.97 
 
 
413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  40.23 
 
 
783 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  43.18 
 
 
835 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  42.55 
 
 
862 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  39.85 
 
 
810 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  32.27 
 
 
848 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  44.44 
 
 
838 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  36.34 
 
 
840 aa  170  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  37.27 
 
 
422 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  38.3 
 
 
835 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  41.22 
 
 
877 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  33.18 
 
 
878 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  37.43 
 
 
823 aa  167  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  37.85 
 
 
406 aa  167  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  39.1 
 
 
783 aa  167  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  39.1 
 
 
783 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  36.98 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  41.49 
 
 
828 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  38.85 
 
 
826 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  39.15 
 
 
767 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  35.03 
 
 
839 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  36.2 
 
 
836 aa  164  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  31.99 
 
 
413 aa  163  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  36.03 
 
 
852 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  36.84 
 
 
826 aa  162  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  41.85 
 
 
825 aa  159  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  32.22 
 
 
411 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  33.43 
 
 
723 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  38.03 
 
 
716 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  36.6 
 
 
420 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  37.26 
 
 
817 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  34.89 
 
 
722 aa  158  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  39 
 
 
783 aa  158  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  40.32 
 
 
805 aa  157  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  38.05 
 
 
418 aa  157  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  33.9 
 
 
396 aa  157  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  34.24 
 
 
414 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  27.43 
 
 
746 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  32.46 
 
 
408 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  39.69 
 
 
835 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  31.71 
 
 
411 aa  154  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  31.98 
 
 
419 aa  154  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  32.53 
 
 
420 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.76 
 
 
409 aa  154  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  41.76 
 
 
805 aa  154  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  36.33 
 
 
427 aa  153  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.76 
 
 
409 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  35.58 
 
 
430 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.03 
 
 
406 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  35.61 
 
 
873 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  36.33 
 
 
439 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  34.32 
 
 
835 aa  151  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  35.59 
 
 
471 aa  150  5e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  33.99 
 
 
442 aa  150  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  29.4 
 
 
426 aa  150  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  33.82 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  39.08 
 
 
841 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  33.22 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  34.15 
 
 
439 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  28.71 
 
 
406 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  34.9 
 
 
403 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  35.96 
 
 
412 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  35.58 
 
 
404 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  33.57 
 
 
417 aa  147  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  34.64 
 
 
415 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  33.69 
 
 
417 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  39.47 
 
 
435 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  35.64 
 
 
416 aa  147  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  30.75 
 
 
736 aa  147  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  34.9 
 
 
403 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  35.06 
 
 
635 aa  146  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  41.73 
 
 
757 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  34.16 
 
 
405 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  32.1 
 
 
420 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  35.23 
 
 
403 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  33.57 
 
 
417 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  33.67 
 
 
410 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  38.49 
 
 
748 aa  144  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>