More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0228 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  100 
 
 
403 aa  826    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  77.06 
 
 
403 aa  667    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  93.8 
 
 
403 aa  783    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  90.82 
 
 
403 aa  768    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  69.73 
 
 
421 aa  592  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  39.7 
 
 
401 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  38.42 
 
 
414 aa  287  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  41.69 
 
 
406 aa  285  9e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1288  peptidase U32  36.69 
 
 
423 aa  282  8.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0903  peptidase U32  39.08 
 
 
413 aa  275  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225282  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  36.39 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  38.08 
 
 
416 aa  273  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  36.05 
 
 
396 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  36.39 
 
 
420 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  36.23 
 
 
411 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  35.68 
 
 
413 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  35.37 
 
 
414 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  34.71 
 
 
422 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  35.04 
 
 
415 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  38.73 
 
 
408 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  38.62 
 
 
406 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  34.78 
 
 
420 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.16 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.48 
 
 
407 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  36.52 
 
 
411 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  37.23 
 
 
409 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  37.23 
 
 
409 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  37.47 
 
 
426 aa  233  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  34.81 
 
 
838 aa  233  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  38.38 
 
 
405 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  38.29 
 
 
419 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  36.59 
 
 
783 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  40.58 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  40.98 
 
 
439 aa  225  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  38.61 
 
 
404 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  35.28 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  33.74 
 
 
835 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.84 
 
 
836 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  34.63 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  42.67 
 
 
767 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  35.53 
 
 
412 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  34.32 
 
 
848 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  33.92 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  33.33 
 
 
404 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  38.89 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  32.59 
 
 
886 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  33.17 
 
 
847 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  38.71 
 
 
435 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  37.08 
 
 
412 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  32.69 
 
 
430 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  34.71 
 
 
411 aa  206  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  32.48 
 
 
404 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  32.02 
 
 
862 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  35.6 
 
 
410 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  32.2 
 
 
435 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  39.48 
 
 
548 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  33.66 
 
 
810 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  33.18 
 
 
438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  33.5 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  32.52 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  31.93 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  31.1 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  33.83 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  33.17 
 
 
426 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  33.42 
 
 
426 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  31.62 
 
 
452 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  37.5 
 
 
783 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  31.77 
 
 
422 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  31.77 
 
 
422 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  34.75 
 
 
823 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  33.17 
 
 
426 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  33.17 
 
 
426 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  33.17 
 
 
426 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  33.17 
 
 
426 aa  193  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  33.17 
 
 
426 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  33.17 
 
 
426 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  33.17 
 
 
426 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  33.17 
 
 
426 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  34.35 
 
 
422 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  35.1 
 
 
406 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  32.52 
 
 
426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  37.9 
 
 
411 aa  190  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  33.82 
 
 
826 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  33.52 
 
 
413 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  35.91 
 
 
790 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  35.62 
 
 
835 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  36.63 
 
 
471 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  31.03 
 
 
839 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  36.36 
 
 
783 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  30.51 
 
 
454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  36.07 
 
 
783 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  32.2 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  30.68 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  30.54 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  30.54 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  30.54 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  34.15 
 
 
723 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  31.12 
 
 
453 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  32.71 
 
 
841 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  35.23 
 
 
851 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>