More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2093 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  100 
 
 		 413 aa  859    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  75.24 
 
 		 413 aa  660    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  81.33 
 
 		 420 aa  721    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  72.48 
 
 		 422 aa  629  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  63.48 
 
 		 420 aa  547  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  60.98 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  61.63 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0903  peptidase U32  43.81 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225282  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  43.37 
 
 		 416 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  42.52 
 
 		 414 aa  335  9e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1288  peptidase U32  43.5 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  39.56 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  38.44 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  36.39 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  36.14 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  36.53 
 
 		 421 aa  269  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  36.17 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  36.56 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  38.66 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  39.14 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  37.19 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  39.43 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  38.74 
 
 		 823 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  41.5 
 
 		 826 aa  232  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  34.31 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  40.19 
 
 		 783 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  34.65 
 
 		 835 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  38.66 
 
 		 767 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  34.73 
 
 		 837 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  37.16 
 
 		 851 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  37.65 
 
 		 723 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  35.2 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  35.47 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  34.13 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  38.44 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  33.33 
 
 		 847 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  33.92 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  36.07 
 
 		 852 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  33.82 
 
 		 872 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  35.7 
 
 		 409 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  35.85 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  34.09 
 
 		 848 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  34.03 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  36.28 
 
 		 877 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  35.44 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  35.4 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  33.51 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  32.68 
 
 		 862 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  36.77 
 
 		 835 aa  213  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  31.82 
 
 		 439 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  36.65 
 
 		 810 aa  212  9e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  37.58 
 
 		 783 aa  212  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  40.88 
 
 		 548 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  37.03 
 
 		 839 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  35.18 
 
 		 840 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  35.31 
 
 		 430 aa  209  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  37.09 
 
 		 790 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  36.8 
 
 		 792 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  33.42 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  32.58 
 
 		 886 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  31.9 
 
 		 828 aa  206  9e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  32.93 
 
 		 835 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  32.9 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  32.43 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  32.47 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  30.66 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  30.66 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  33.42 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  37.62 
 
 		 835 aa  203  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  35.38 
 
 		 430 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  33.01 
 
 		 790 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  38.24 
 
 		 422 aa  203  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  31.37 
 
 		 838 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  35.2 
 
 		 442 aa  202  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  32.52 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  35.73 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  39.15 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.49 
 
 		 836 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  33.51 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  39.22 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  35.68 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  34.75 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  31.26 
 
 		 826 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  32.83 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  29.88 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  33.96 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  29.88 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  39.17 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  30.93 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  30.93 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  30.93 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  30.93 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  30.93 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  30.93 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  36.14 
 
 		 843 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  30.93 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  36.62 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  32.4 
 
 		 878 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  29.88 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  32.44 
 
 		 783 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>