More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0903 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  78.4 
 
 
416 aa  699    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0903  peptidase U32  100 
 
 
413 aa  858    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225282  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  54.07 
 
 
414 aa  475  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1288  peptidase U32  52.06 
 
 
423 aa  457  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  43.81 
 
 
413 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  43.1 
 
 
422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  42.55 
 
 
420 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  42.14 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  43.23 
 
 
415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  42.79 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  42.75 
 
 
413 aa  330  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  38.73 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  38.35 
 
 
403 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  39.08 
 
 
403 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  39.71 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  35.49 
 
 
421 aa  256  6e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  36.19 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  34.54 
 
 
406 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  35.75 
 
 
401 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  36.23 
 
 
411 aa  244  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  38.02 
 
 
439 aa  219  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  38.51 
 
 
783 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.46 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  32.35 
 
 
862 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  33.16 
 
 
407 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  36.31 
 
 
420 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  35.08 
 
 
837 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  38.64 
 
 
823 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  31.84 
 
 
405 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  33 
 
 
886 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  37.11 
 
 
835 aa  202  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  34.19 
 
 
409 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  34.19 
 
 
409 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  35.49 
 
 
839 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  35.6 
 
 
810 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  31.93 
 
 
835 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  32.46 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  32.53 
 
 
877 aa  200  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  33.9 
 
 
851 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  33.87 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  34.56 
 
 
828 aa  197  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  33.76 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  33.93 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  39.68 
 
 
873 aa  196  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  36.28 
 
 
835 aa  196  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  32.37 
 
 
406 aa  196  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  35.71 
 
 
826 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  34.97 
 
 
767 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  33.92 
 
 
852 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  31.25 
 
 
838 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  31.3 
 
 
406 aa  192  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  29.43 
 
 
847 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  33.12 
 
 
411 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  32.91 
 
 
412 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  32.91 
 
 
439 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  31.81 
 
 
835 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  29.79 
 
 
872 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  33.84 
 
 
783 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  35.26 
 
 
841 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  35.15 
 
 
833 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  30.81 
 
 
848 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  32.53 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  36.22 
 
 
723 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  33.23 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  29.28 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  34.71 
 
 
430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  33.83 
 
 
847 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  33.76 
 
 
428 aa  182  7e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  33.14 
 
 
423 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  29.95 
 
 
818 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  34.71 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  31.66 
 
 
430 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  33.65 
 
 
428 aa  179  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  35.48 
 
 
805 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  35.84 
 
 
825 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  32.65 
 
 
832 aa  176  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  32.47 
 
 
826 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  35.58 
 
 
426 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  35.19 
 
 
411 aa  176  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  33.93 
 
 
548 aa  176  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  30.69 
 
 
422 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  32.37 
 
 
471 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  34.18 
 
 
783 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  31.43 
 
 
403 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  31.96 
 
 
422 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  34.18 
 
 
783 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  31.09 
 
 
410 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  31.19 
 
 
404 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  28.19 
 
 
836 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  32.38 
 
 
426 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  28.99 
 
 
822 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  33.03 
 
 
408 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  30.43 
 
 
422 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  30.43 
 
 
422 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  32.7 
 
 
840 aa  170  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  30.99 
 
 
422 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  29.92 
 
 
790 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  34.14 
 
 
843 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  30.99 
 
 
404 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  30.18 
 
 
426 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>