More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2495 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  75.24 
 
 		 413 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  100 
 
 		 413 aa  855    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  71.57 
 
 		 422 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  79.08 
 
 		 420 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  63.5 
 
 		 420 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  62.84 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  62.9 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0903  peptidase U32  42.75 
 
 		 413 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225282  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  42.79 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1288  peptidase U32  42.45 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  41.79 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  41.49 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  41.49 
 
 		 411 aa  301  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  39.32 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  35.68 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  37.05 
 
 		 403 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  35.77 
 
 		 403 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  35.68 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  37.26 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  36.87 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  36.86 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  40.95 
 
 		 783 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  39.94 
 
 		 767 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  38.12 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  40.12 
 
 		 408 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  36.76 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  31.65 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  38.05 
 
 		 826 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  36.22 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  33.09 
 
 		 411 aa  227  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  37.28 
 
 		 723 aa  222  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  34.91 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  37.58 
 
 		 835 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  34.46 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  36.73 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  37.35 
 
 		 419 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  34.67 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  34.52 
 
 		 837 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.07 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  34.93 
 
 		 835 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  37.25 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  34.49 
 
 		 877 aa  215  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  37.54 
 
 		 823 aa  215  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  35.79 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  36.31 
 
 		 783 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  35.29 
 
 		 852 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  35.78 
 
 		 872 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  31.58 
 
 		 886 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  33.01 
 
 		 839 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  34.15 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  32.84 
 
 		 848 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  39.13 
 
 		 548 aa  206  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  34.9 
 
 		 851 aa  206  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.45 
 
 		 847 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  33.25 
 
 		 422 aa  206  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  36.89 
 
 		 826 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  32.69 
 
 		 783 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  32.52 
 
 		 783 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  32.04 
 
 		 862 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  31.9 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  31.9 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  34.32 
 
 		 413 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  36.19 
 
 		 873 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  30.53 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  35.81 
 
 		 840 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  33.92 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  30.62 
 
 		 838 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  32.24 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  30.53 
 
 		 426 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  36.48 
 
 		 790 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  31.45 
 
 		 828 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  30.29 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  30.29 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  35.31 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  30.29 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  30.29 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  30.29 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  30.29 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  30.29 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  30.29 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  30.29 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  36.51 
 
 		 792 aa  200  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  32.89 
 
 		 790 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  36.39 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  38.63 
 
 		 790 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  38.89 
 
 		 790 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  32.53 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  31.47 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  32.91 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  33.84 
 
 		 810 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  33.04 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  36.28 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  38.38 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  35.56 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  36.61 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  32.25 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  35.5 
 
 		 792 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  34.86 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  31.98 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  36.5 
 
 		 635 aa  194  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>