More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2234 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  822    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  58.38 
 
 
406 aa  485  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  40.2 
 
 
403 aa  295  7e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  39.7 
 
 
403 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  39.21 
 
 
403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  39.6 
 
 
415 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  39.75 
 
 
403 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0576  peptidase U32  37.74 
 
 
421 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2116  peptidase U32  38.5 
 
 
416 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00231465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  36.23 
 
 
414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  39.32 
 
 
413 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  38.66 
 
 
413 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  38.46 
 
 
396 aa  260  3e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  37.16 
 
 
420 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  39.39 
 
 
405 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  37.38 
 
 
420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  37.5 
 
 
411 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  36.12 
 
 
422 aa  248  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  36.87 
 
 
414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  37.72 
 
 
411 aa  245  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0903  peptidase U32  35.75 
 
 
413 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225282  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1288  peptidase U32  39.25 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  39.5 
 
 
404 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  34.63 
 
 
409 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  34.63 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  40.05 
 
 
419 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  37.5 
 
 
838 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  38.07 
 
 
407 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  38.74 
 
 
427 aa  229  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  34.99 
 
 
847 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  36.76 
 
 
430 aa  228  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  38.87 
 
 
408 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  35.88 
 
 
406 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  35.75 
 
 
406 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  41.69 
 
 
404 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  40.38 
 
 
426 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  32.37 
 
 
411 aa  223  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  38.61 
 
 
403 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  35.86 
 
 
848 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  33.66 
 
 
404 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  36.86 
 
 
783 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  37.65 
 
 
430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  34.89 
 
 
886 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  34.16 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  33.58 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  39.47 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  34.75 
 
 
810 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  39.34 
 
 
439 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  40 
 
 
411 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  36.25 
 
 
835 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  38.69 
 
 
412 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  35 
 
 
862 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  36.39 
 
 
412 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  32.35 
 
 
428 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  37.83 
 
 
422 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  37.34 
 
 
422 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  34.96 
 
 
836 aa  202  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  41.74 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  35.08 
 
 
877 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  33.15 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  38.46 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  33.59 
 
 
835 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  40.15 
 
 
767 aa  199  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  36.04 
 
 
426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  35.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  33.75 
 
 
723 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  33.05 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  31.46 
 
 
826 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  33.43 
 
 
837 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  34.84 
 
 
426 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  39.6 
 
 
823 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  37.46 
 
 
435 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  38.33 
 
 
826 aa  193  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  36.67 
 
 
548 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  32.09 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  37.34 
 
 
414 aa  189  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  38.19 
 
 
419 aa  189  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  38.55 
 
 
783 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  36.04 
 
 
471 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  38.55 
 
 
783 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  32.84 
 
 
872 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  35.81 
 
 
417 aa  186  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  36.52 
 
 
817 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  33.43 
 
 
835 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  39.1 
 
 
790 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  33.33 
 
 
840 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  34.9 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  37.66 
 
 
418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  35.2 
 
 
835 aa  183  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  31.81 
 
 
447 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  31.82 
 
 
828 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  36.63 
 
 
851 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>