More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0074 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  53.08 
 
 		 656 aa  687    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  66.92 
 
 		 748 aa  879    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  70.3 
 
 		 709 aa  945    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  100 
 
 		 697 aa  1425    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  51.75 
 
 		 654 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  48.33 
 
 		 656 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0024  peptidase U32  61.18 
 
 		 754 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  30.97 
 
 		 696 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  42.36 
 
 		 822 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  39.62 
 
 		 818 aa  237  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  41.35 
 
 		 790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  40.29 
 
 		 790 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  41.06 
 
 		 792 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  41 
 
 		 790 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  38.78 
 
 		 792 aa  230  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  41.98 
 
 		 790 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  39.87 
 
 		 746 aa  217  5e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  40.74 
 
 		 886 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  34.36 
 
 		 810 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  36.67 
 
 		 847 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  32.28 
 
 		 828 aa  194  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  43.45 
 
 		 835 aa  194  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  36.22 
 
 		 825 aa  194  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  37.5 
 
 		 783 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  36.7 
 
 		 783 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  34.22 
 
 		 839 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  37.46 
 
 		 840 aa  186  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  37.15 
 
 		 848 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  40.53 
 
 		 783 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  40.62 
 
 		 835 aa  183  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  33.81 
 
 		 872 aa  183  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  42.75 
 
 		 783 aa  182  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  34.72 
 
 		 817 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  29.95 
 
 		 767 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  37.82 
 
 		 836 aa  180  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.78 
 
 		 411 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  37 
 
 		 805 aa  177  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  34.48 
 
 		 723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  41.95 
 
 		 862 aa  174  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.45 
 
 		 409 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.45 
 
 		 409 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  37.17 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  36.2 
 
 		 408 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  40.18 
 
 		 873 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  35.52 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  38.63 
 
 		 838 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  35.03 
 
 		 826 aa  172  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  37.79 
 
 		 406 aa  170  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  34.25 
 
 		 839 aa  169  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  37.62 
 
 		 877 aa  168  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  37.05 
 
 		 422 aa  167  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  38.13 
 
 		 805 aa  166  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  36.77 
 
 		 411 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  41.82 
 
 		 878 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  40.45 
 
 		 841 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  37.99 
 
 		 826 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  37.75 
 
 		 835 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  37.18 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  34.63 
 
 		 406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  34.49 
 
 		 834 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  36.99 
 
 		 746 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  37.34 
 
 		 442 aa  161  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  38.85 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  35.77 
 
 		 430 aa  160  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  35.91 
 
 		 716 aa  160  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  31.25 
 
 		 419 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  36.26 
 
 		 439 aa  158  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  32.99 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  36.73 
 
 		 418 aa  157  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  34.81 
 
 		 403 aa  157  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  31.19 
 
 		 426 aa  157  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  38.99 
 
 		 412 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  35.9 
 
 		 420 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  36.5 
 
 		 722 aa  156  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  37.45 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  34.71 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  39.25 
 
 		 757 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  36.3 
 
 		 837 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  35.38 
 
 		 420 aa  154  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  34.55 
 
 		 414 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  38.77 
 
 		 404 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  35.15 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  39.78 
 
 		 835 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  37 
 
 		 851 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  39.56 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  34.4 
 
 		 655 aa  151  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  37.5 
 
 		 823 aa  151  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  34.53 
 
 		 621 aa  151  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  36.63 
 
 		 410 aa  151  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  36.27 
 
 		 832 aa  150  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  32.99 
 
 		 403 aa  150  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  30.62 
 
 		 736 aa  150  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  35.9 
 
 		 407 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  34.69 
 
 		 411 aa  150  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  35.8 
 
 		 666 aa  150  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1542  collagenase  34.06 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  33.58 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  31.66 
 
 		 422 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  36.63 
 
 		 404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  36.47 
 
 		 672 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>