More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0957 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0957  collagenase-like protease  100 
 
 		 643 aa  1317    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0908875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  35.19 
 
 		 667 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  42.05 
 
 		 847 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  45.86 
 
 		 783 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  43.43 
 
 		 783 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  41.14 
 
 		 848 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  45.36 
 
 		 835 aa  240  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  42.42 
 
 		 886 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  40.39 
 
 		 835 aa  236  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  40.07 
 
 		 862 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  40.26 
 
 		 810 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  40.72 
 
 		 839 aa  234  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  39.67 
 
 		 404 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  39.81 
 
 		 872 aa  230  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  38.69 
 
 		 406 aa  227  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  37.34 
 
 		 411 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  40.85 
 
 		 838 aa  225  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  43.3 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  43.3 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  42.15 
 
 		 839 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  41.5 
 
 		 805 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  37.34 
 
 		 419 aa  218  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  45.04 
 
 		 790 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  38.16 
 
 		 410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  44.27 
 
 		 792 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  41.16 
 
 		 767 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  37.19 
 
 		 836 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  43.82 
 
 		 790 aa  213  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  34.97 
 
 		 407 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  43.71 
 
 		 834 aa  211  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  40.13 
 
 		 873 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  36.51 
 
 		 411 aa  209  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.6 
 
 		 406 aa  208  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  42.86 
 
 		 822 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  43.24 
 
 		 818 aa  207  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  37.5 
 
 		 404 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  37.87 
 
 		 435 aa  206  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  32.2 
 
 		 746 aa  205  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  38.55 
 
 		 817 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  43.24 
 
 		 790 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  33.88 
 
 		 409 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  39.02 
 
 		 412 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  41.29 
 
 		 790 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  35.62 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  38.36 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  42.47 
 
 		 792 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  33.55 
 
 		 409 aa  203  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  36.51 
 
 		 404 aa  203  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  34.84 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  36.97 
 
 		 835 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  37.79 
 
 		 413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  33.88 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  33.88 
 
 		 403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  39.16 
 
 		 837 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  35.18 
 
 		 412 aa  197  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  33.77 
 
 		 405 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  30.72 
 
 		 408 aa  193  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  36.84 
 
 		 832 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  41.04 
 
 		 823 aa  191  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  39.11 
 
 		 852 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  37.83 
 
 		 723 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  36.2 
 
 		 722 aa  187  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  36.36 
 
 		 420 aa  187  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  32.14 
 
 		 422 aa  187  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  37.91 
 
 		 669 aa  186  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  36.67 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  35.67 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  38.6 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  38.6 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  38.6 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  39.56 
 
 		 828 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  38.6 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  38.6 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  32.14 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  32.14 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  37.41 
 
 		 668 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  37.68 
 
 		 654 aa  184  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  37.28 
 
 		 666 aa  183  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  38.38 
 
 		 653 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  33.81 
 
 		 716 aa  183  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  38.01 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  38.01 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  36.17 
 
 		 666 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  38.01 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  37.41 
 
 		 668 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  38.01 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  36.17 
 
 		 666 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  38.01 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  38.01 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  38.01 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  36.43 
 
 		 696 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  37.5 
 
 		 655 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  32.89 
 
 		 422 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  37.18 
 
 		 662 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  39.05 
 
 		 652 aa  179  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  34.43 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  33.01 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  36.57 
 
 		 877 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  32.76 
 
 		 422 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  33.33 
 
 		 406 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>