More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2870 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  69.28 
 
 		 653 aa  952    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  69.28 
 
 		 653 aa  952    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  69.28 
 
 		 653 aa  952    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  95.65 
 
 		 666 aa  1328    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  69.13 
 
 		 667 aa  950    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  68.59 
 
 		 654 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  69.13 
 
 		 653 aa  951    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  69.13 
 
 		 667 aa  950    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  55.64 
 
 		 655 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  52.86 
 
 		 669 aa  688    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  86.38 
 
 		 668 aa  1172    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  55.99 
 
 		 652 aa  679    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2431  peptidase U32  95.28 
 
 		 657 aa  1305    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  86.08 
 
 		 668 aa  1197    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  52.34 
 
 		 629 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  69.13 
 
 		 667 aa  950    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  56.21 
 
 		 667 aa  698    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  87.07 
 
 		 669 aa  1211    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  86.94 
 
 		 662 aa  1197    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  54.22 
 
 		 667 aa  669    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  68.59 
 
 		 654 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  76.1 
 
 		 666 aa  1056    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  68.59 
 
 		 654 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  69.13 
 
 		 667 aa  950    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  70.03 
 
 		 654 aa  958    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  54.01 
 
 		 672 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  53.56 
 
 		 640 aa  680    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  54.22 
 
 		 692 aa  665    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  68.74 
 
 		 654 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  68.74 
 
 		 654 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  95.8 
 
 		 666 aa  1330    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2870  peptidase U32  100 
 
 		 666 aa  1379    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.615102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4811  peptidase U32  54.15 
 
 		 668 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0604959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  50.08 
 
 		 638 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  50.16 
 
 		 638 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  50.16 
 
 		 638 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  50 
 
 		 638 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  49.54 
 
 		 638 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  50.32 
 
 		 638 aa  591  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  49.92 
 
 		 638 aa  592  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  49.45 
 
 		 637 aa  588  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  49.61 
 
 		 638 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  48.6 
 
 		 667 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  50.08 
 
 		 638 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  48.2 
 
 		 644 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  50 
 
 		 638 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  49.92 
 
 		 639 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  48.04 
 
 		 649 aa  581  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  48.34 
 
 		 641 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  40.92 
 
 		 622 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  39.59 
 
 		 621 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  39.57 
 
 		 635 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  32.77 
 
 		 810 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  31.48 
 
 		 783 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  30.24 
 
 		 847 aa  243  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  32.97 
 
 		 835 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  34.15 
 
 		 862 aa  235  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  37.11 
 
 		 847 aa  234  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  30.71 
 
 		 872 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  32.27 
 
 		 886 aa  226  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  32.26 
 
 		 783 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  32.45 
 
 		 783 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  29.93 
 
 		 839 aa  220  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  31.87 
 
 		 848 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  32.83 
 
 		 841 aa  213  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  37.57 
 
 		 835 aa  210  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  30.32 
 
 		 837 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  33.33 
 
 		 835 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  29.73 
 
 		 817 aa  208  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  30.71 
 
 		 838 aa  208  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  29.82 
 
 		 783 aa  207  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  29.42 
 
 		 767 aa  206  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  34.1 
 
 		 852 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  33.21 
 
 		 851 aa  204  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  30.55 
 
 		 825 aa  204  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  33.9 
 
 		 833 aa  203  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  32.77 
 
 		 835 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  33.96 
 
 		 873 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  32.28 
 
 		 877 aa  201  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.13 
 
 		 836 aa  201  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  32.2 
 
 		 823 aa  200  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  36.52 
 
 		 723 aa  197  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  32.02 
 
 		 828 aa  196  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  29.78 
 
 		 826 aa  195  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  29.79 
 
 		 826 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  37.09 
 
 		 407 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  39.06 
 
 		 840 aa  191  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  36.93 
 
 		 822 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  27.97 
 
 		 722 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  36.27 
 
 		 832 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  38.16 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  37.23 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  37.23 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  37.09 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  31.13 
 
 		 406 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  27.7 
 
 		 716 aa  187  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  38.31 
 
 		 747 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  32.16 
 
 		 843 aa  187  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  38.64 
 
 		 748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  38.13 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>