66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1814 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1944  sodium/proton antiporter  67.66 
 
 
514 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0398014  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2000  sodium/proton antiporter  69.06 
 
 
524 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0154375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02930  sodium/proton antiporter  72.23 
 
 
528 aa  705    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1289  sodium/proton antiporter  68.24 
 
 
513 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000535584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1331  sodium/proton antiporter  68.24 
 
 
513 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000004617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2513  sodium/proton antiporter  82.93 
 
 
527 aa  886    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000214926  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2749  sodium/proton antiporter  65.5 
 
 
526 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000080955  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2439  sodium/proton antiporter  83.52 
 
 
528 aa  904    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1814  sodium/proton antiporter  100 
 
 
533 aa  1075    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000040103  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2364  sodium/proton antiporter  69.06 
 
 
522 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2110  sodium/proton antiporter  69.06 
 
 
524 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2439  sodium/proton antiporter  68.24 
 
 
513 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000874928  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1963  sodium/proton antiporter  68.03 
 
 
513 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000140006  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2690  sodium/proton antiporter  85.58 
 
 
528 aa  903    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00015622  normal  0.358514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1344  sodium/proton antiporter  68.24 
 
 
513 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000388765  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2462  Na+/H+ antiporter NhaB  68.24 
 
 
513 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2004  sodium/proton antiporter  67.47 
 
 
514 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.223216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1948  sodium/proton antiporter  67.86 
 
 
514 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.696953  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01147  sodium/proton antiporter  68.62 
 
 
520 aa  711    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1327  sodium/proton antiporter  67.66 
 
 
514 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1512  sodium/proton antiporter  67.47 
 
 
514 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210901  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2148  sodium/proton antiporter  70.47 
 
 
531 aa  729    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1673  sodium/proton antiporter  68.24 
 
 
513 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000094034  normal  0.63338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2508  sodium/proton antiporter  100 
 
 
533 aa  1075    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0022758  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1984  sodium/proton antiporter  65.94 
 
 
524 aa  649    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01171  hypothetical protein  68.24 
 
 
513 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000261318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1947  sodium/proton antiporter  63.71 
 
 
526 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2243  sodium/proton antiporter  64.29 
 
 
526 aa  661    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00099242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002978  Na+/H+ antiporter  71.35 
 
 
528 aa  743    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1770  sodium/proton antiporter  100 
 
 
533 aa  1075    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000537297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1567  sodium/proton antiporter  90.99 
 
 
533 aa  970    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000581979  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1642  sodium/proton antiporter  90.99 
 
 
533 aa  970    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00536315  hitchhiker  0.00651417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1742  sodium/proton antiporter  84.24 
 
 
528 aa  893    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2795  sodium/proton antiporter  67.11 
 
 
526 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0542405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1634  sodium/proton antiporter  90.81 
 
 
533 aa  989    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000708329  normal  0.136826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1925  sodium/proton antiporter  84.02 
 
 
528 aa  906    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000922485  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1634  sodium/proton antiporter  80.68 
 
 
528 aa  885    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1777  sodium/proton antiporter  100 
 
 
533 aa  1075    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2175  sodium/proton antiporter  84.49 
 
 
531 aa  890    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136342  normal  0.0115207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2366  sodium/proton antiporter  65.27 
 
 
512 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000849629  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1682  sodium/proton antiporter  90.43 
 
 
528 aa  961    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000237317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1491  sodium/proton antiporter  70.65 
 
 
530 aa  740    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2886  sodium/proton antiporter  91.18 
 
 
533 aa  996    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01161  sodium/proton antiporter  68.24 
 
 
513 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000392786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1706  sodium/proton antiporter  60.69 
 
 
500 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873135  normal  0.138705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2589  sodium/proton antiporter  60.88 
 
 
500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3871  sodium/proton antiporter  62.1 
 
 
504 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.994006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2020  sodium/proton antiporter  64.6 
 
 
499 aa  570  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.974157  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4031  sodium/proton antiporter  58.8 
 
 
500 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1807  sodium/proton antiporter  59 
 
 
500 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933013  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3630  sodium/proton antiporter  59.4 
 
 
500 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3477  sodium/proton antiporter  61.2 
 
 
500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41000  sodium/proton antiporter  61 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  27.53 
 
 
419 aa  54.7  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.13 
 
 
429 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  27.59 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.17 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.17 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  24.67 
 
 
431 aa  47  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  28.92 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  23.68 
 
 
451 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  43.48 
 
 
429 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.77 
 
 
328 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  27.21 
 
 
424 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  26.67 
 
 
419 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  30.23 
 
 
431 aa  43.9  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>