65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3630 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3630  sodium/proton antiporter  100 
 
 		 500 aa  998    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4031  sodium/proton antiporter  95.4 
 
 		 500 aa  903    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2589  sodium/proton antiporter  83.6 
 
 		 500 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3477  sodium/proton antiporter  75.2 
 
 		 500 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1706  sodium/proton antiporter  61.4 
 
 		 500 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873135  normal  0.138705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1807  sodium/proton antiporter  97 
 
 		 500 aa  893    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3871  sodium/proton antiporter  67.94 
 
 		 504 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.994006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41000  sodium/proton antiporter  76 
 
 		 500 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002978  Na+/H+ antiporter  59.28 
 
 		 528 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2749  sodium/proton antiporter  59.24 
 
 		 526 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000080955  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1634  sodium/proton antiporter  59.4 
 
 		 533 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000708329  normal  0.136826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2886  sodium/proton antiporter  59 
 
 		 533 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1491  sodium/proton antiporter  58.88 
 
 		 530 aa  595  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2439  sodium/proton antiporter  59.27 
 
 		 528 aa  594  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1634  sodium/proton antiporter  59.15 
 
 		 528 aa  591  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000378867  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1642  sodium/proton antiporter  59.01 
 
 		 533 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00536315  hitchhiker  0.00651417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1567  sodium/proton antiporter  59.01 
 
 		 533 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000581979  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1947  sodium/proton antiporter  60.24 
 
 		 526 aa  585  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2690  sodium/proton antiporter  59.07 
 
 		 528 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00015622  normal  0.358514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1742  sodium/proton antiporter  59.48 
 
 		 528 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1682  sodium/proton antiporter  59.44 
 
 		 528 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000237317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1925  sodium/proton antiporter  59.07 
 
 		 528 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000922485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2243  sodium/proton antiporter  59.64 
 
 		 526 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00099242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1814  sodium/proton antiporter  59.4 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000040103  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2508  sodium/proton antiporter  59.4 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0022758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1777  sodium/proton antiporter  59.4 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1770  sodium/proton antiporter  59.4 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000537297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2513  sodium/proton antiporter  58.27 
 
 		 527 aa  581  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000214926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1344  sodium/proton antiporter  61.16 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000388765  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2462  Na+/H+ antiporter NhaB  61.16 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2439  sodium/proton antiporter  61.16 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000874928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1963  sodium/proton antiporter  61.16 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000140006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01171  hypothetical protein  61.16 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000261318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2004  sodium/proton antiporter  60 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.223216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1944  sodium/proton antiporter  60 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0398014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1673  sodium/proton antiporter  61.16 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000094034  normal  0.63338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1512  sodium/proton antiporter  60 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1327  sodium/proton antiporter  60 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1331  sodium/proton antiporter  61.16 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000004617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1289  sodium/proton antiporter  61.16 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000535584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2366  sodium/proton antiporter  59.8 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000849629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01161  sodium/proton antiporter  61.16 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000392786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1948  sodium/proton antiporter  59.8 
 
 		 514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.696953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2175  sodium/proton antiporter  57.23 
 
 		 531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136342  normal  0.0115207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2148  sodium/proton antiporter  58.25 
 
 		 531 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02930  sodium/proton antiporter  59.28 
 
 		 528 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2795  sodium/proton antiporter  57.72 
 
 		 526 aa  567  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0542405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1984  sodium/proton antiporter  59.67 
 
 		 524 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2364  sodium/proton antiporter  60.28 
 
 		 522 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2020  sodium/proton antiporter  63.1 
 
 		 499 aa  558  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.974157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2110  sodium/proton antiporter  60.28 
 
 		 524 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2000  sodium/proton antiporter  60.28 
 
 		 524 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0154375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01147  sodium/proton antiporter  58.4 
 
 		 520 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  23.32 
 
 		 431 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.96 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.33 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  27.18 
 
 		 427 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  33.33 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.56 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.56 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.56 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  41.07 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  32.98 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  28.37 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  25.96 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>