64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2020 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002978  Na+/H+ antiporter  67.2 
 
 		 528 aa  666    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2439  sodium/proton antiporter  63.62 
 
 		 528 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02930  sodium/proton antiporter  68.4 
 
 		 528 aa  641    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1706  sodium/proton antiporter  69.51 
 
 		 500 aa  706    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873135  normal  0.138705 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2148  sodium/proton antiporter  66.46 
 
 		 531 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1491  sodium/proton antiporter  66.53 
 
 		 530 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3871  sodium/proton antiporter  70.24 
 
 		 504 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.994006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1634  sodium/proton antiporter  65 
 
 		 533 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000708329  normal  0.136826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2886  sodium/proton antiporter  64.6 
 
 		 533 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2020  sodium/proton antiporter  100 
 
 		 499 aa  994    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.974157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1634  sodium/proton antiporter  64.19 
 
 		 528 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1682  sodium/proton antiporter  65.92 
 
 		 528 aa  633  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000237317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1925  sodium/proton antiporter  63.41 
 
 		 528 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000922485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1567  sodium/proton antiporter  64.4 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000581979  normal  0.983866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2749  sodium/proton antiporter  62.9 
 
 		 526 aa  628  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000080955  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1642  sodium/proton antiporter  64.4 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00536315  hitchhiker  0.00651417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1777  sodium/proton antiporter  64.99 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2508  sodium/proton antiporter  64.99 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0022758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1814  sodium/proton antiporter  64.99 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000040103  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1770  sodium/proton antiporter  64.99 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000537297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1947  sodium/proton antiporter  63.56 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2690  sodium/proton antiporter  63.41 
 
 		 528 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00015622  normal  0.358514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2243  sodium/proton antiporter  63.73 
 
 		 526 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00099242  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1742  sodium/proton antiporter  62.5 
 
 		 528 aa  614  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2513  sodium/proton antiporter  62.6 
 
 		 527 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000214926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01147  sodium/proton antiporter  62.5 
 
 		 520 aa  616  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2175  sodium/proton antiporter  62.96 
 
 		 531 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136342  normal  0.0115207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1944  sodium/proton antiporter  64.1 
 
 		 514 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0398014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1512  sodium/proton antiporter  63.89 
 
 		 514 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2004  sodium/proton antiporter  63.69 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.223216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1948  sodium/proton antiporter  64.1 
 
 		 514 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.696953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1327  sodium/proton antiporter  63.89 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2795  sodium/proton antiporter  62.15 
 
 		 526 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0542405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2589  sodium/proton antiporter  65.12 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2366  sodium/proton antiporter  62.88 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000849629  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2462  Na+/H+ antiporter NhaB  62.53 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1673  sodium/proton antiporter  62.53 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000094034  normal  0.63338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1344  sodium/proton antiporter  62.53 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000388765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01171  hypothetical protein  62.53 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000261318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1963  sodium/proton antiporter  62.53 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000140006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2439  sodium/proton antiporter  62.53 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000874928  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01161  sodium/proton antiporter  62.53 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000392786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1331  sodium/proton antiporter  62.53 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000004617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1289  sodium/proton antiporter  62.53 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000535584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4031  sodium/proton antiporter  62.7 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.806507  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2364  sodium/proton antiporter  63.24 
 
 		 522 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00206489  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1807  sodium/proton antiporter  63.1 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1984  sodium/proton antiporter  61.36 
 
 		 524 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3630  sodium/proton antiporter  62.9 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2000  sodium/proton antiporter  63.45 
 
 		 524 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0154375  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2110  sodium/proton antiporter  63.45 
 
 		 524 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3477  sodium/proton antiporter  66.53 
 
 		 500 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41000  sodium/proton antiporter  66.13 
 
 		 500 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.7 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  28.81 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  26.04 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  29.06 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  28.36 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  25.79 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.47 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  31.82 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  22.68 
 
 		 421 aa  43.9  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  25.46 
 
 		 431 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  27.27 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>