100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3242 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  100 
 
 
64 aa  130  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  54.69 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  53.23 
 
 
64 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  46.03 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  53.12 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  52.46 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  47.62 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  50 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  53.57 
 
 
66 aa  57  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  50 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  56 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  56 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  56 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  42.62 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  42.62 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  43.75 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  49.09 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  46.67 
 
 
77 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  40.32 
 
 
73 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  56 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  44.26 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  39.68 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  49.21 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  45.16 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  48.39 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  39.68 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  43.55 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  35.48 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  35.48 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  35.48 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  40.98 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  43.55 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  39.06 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  37.1 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  39.66 
 
 
71 aa  48.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  46.77 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  42.37 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  39.34 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  37.7 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  44.62 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  40.68 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  43.75 
 
 
66 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  35.48 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.29 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  40.68 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  42.37 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  42.37 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  51.02 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  40.68 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  44.83 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  40.98 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  49.18 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  40.98 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  40.98 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  35.48 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  36.07 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  33.85 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  46.03 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  38.98 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  43.33 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  38.33 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  37.7 
 
 
551 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 
80 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  38.33 
 
 
101 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 
68 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  41.54 
 
 
64 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  41.54 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  37.7 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  37.7 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  40 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  33.9 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  32.89 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  40.98 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  38.33 
 
 
64 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>