60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  100 
 
 		 68 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  50 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  51.61 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  50 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  50 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  44.44 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  41.27 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  44.44 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  41.54 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  52.08 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  52.08 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  52.08 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  45.16 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  45.16 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  41.94 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  51.11 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  40.32 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  50 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  43.55 
 
 		 551 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  42.86 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  41.94 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  40.32 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  41.94 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  43.55 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  35.38 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  40.32 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  38.46 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2769  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  36.92 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  35.38 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  35.38 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  35.38 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  37.1 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  34.43 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  41.38 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  36.67 
 
 		 64 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2694  hypothetical protein  38.71 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00619156  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  36.92 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  36.51 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  38.1 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  38.1 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.71 
 
 		 349 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>