65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4235 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  85.94 
 
 
64 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  65.62 
 
 
64 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  76.56 
 
 
64 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  76.56 
 
 
64 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  76.56 
 
 
64 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  62.5 
 
 
63 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  59.38 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  56.45 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  54.69 
 
 
66 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  54.69 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  57.14 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  51.56 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  51.56 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  53.12 
 
 
65 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  50 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  53.23 
 
 
64 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  43.75 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  48.44 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  46.77 
 
 
81 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  46.03 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  46.88 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  39.06 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  46.88 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  46.03 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  46.03 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  44.44 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  53.12 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  43.75 
 
 
64 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  48.44 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  50.82 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  42.19 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  45.31 
 
 
64 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  44.26 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  43.75 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  47.62 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  35.48 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2523  putative ferredoxin  48.39 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  37.1 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  42.19 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.62 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  35.48 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  39.06 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  37.1 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  43.94 
 
 
62 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  35 
 
 
71 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  40.91 
 
 
62 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  41.94 
 
 
63 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  36.51 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  36.51 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  38.1 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  38.1 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  38.1 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  40.32 
 
 
551 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  34.38 
 
 
63 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40.62 
 
 
349 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>