76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2523 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2523  putative ferredoxin  100 
 
 
66 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  56.45 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  58.06 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  54.84 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  51.61 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  53.57 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  47.62 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  50.79 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  46.03 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  48.39 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  51.61 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  48.39 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  41.94 
 
 
73 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  46.77 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  48.39 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  48.39 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  48.39 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  45 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  48.39 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  46.15 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  46.15 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  39.68 
 
 
65 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  51.72 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  46.03 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  38.71 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  48.48 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  43.94 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  44.62 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  47.54 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  46.77 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  42.62 
 
 
71 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  44.62 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  35.38 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  44.62 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  38.6 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 
63 aa  47  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  44.44 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  45.31 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  40.32 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  50 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  50 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  42.86 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  41.94 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.33 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  46.77 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  46.77 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  44.44 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  40.32 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  46.77 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  43.94 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  43.33 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  35.38 
 
 
69 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  44.64 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  38.71 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  44.64 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.87 
 
 
68 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  37.1 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  35.94 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  35.94 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  35.94 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  41.54 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  29.69 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.67 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  32.26 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  32.26 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  37.1 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  44.64 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  41.67 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  38.33 
 
 
73 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  38.33 
 
 
73 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>