86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  100 
 
 		 63 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  73.44 
 
 		 64 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  62.5 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  57.81 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  56.25 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  56.45 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  56.25 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  59.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  51.56 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  60.71 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  62.5 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  62.5 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  62.5 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  45.16 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  46.88 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  40 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  52.46 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  43.75 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  46.77 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  41.27 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  51.61 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  51.61 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  48.39 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  48.44 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  48.44 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  48.44 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  44.44 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  44.44 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  46.88 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  46.67 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  44.26 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  56.25 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2523  putative ferredoxin  58.06 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  39.68 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  46.03 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  46.03 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  41.27 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  46.03 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  42.86 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  41.94 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  40.32 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  42.86 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  41.27 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  38.71 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  38.71 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1862  ferredoxin  33.33 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0115617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  38.98 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  40.68 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  38.98 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  40.62 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  37.29 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  35.48 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  32.26 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  39.68 
 
 		 349 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.67 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  38.98 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  39.06 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  38.98 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  36.67 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  41.94 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  38.03 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1092  ferredoxin  35.38 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  31.67 
 
 		 505 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>