109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3936 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  100 
 
 		 62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  66.1 
 
 		 63 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  66.1 
 
 		 63 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  64.41 
 
 		 63 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  64.41 
 
 		 63 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  52.54 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.54 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.54 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  51.61 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  46.77 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  48.33 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  47.46 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  46.67 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  46.67 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  49.18 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  49.18 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  49.18 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  41.67 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.54 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  49.18 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  49.18 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  40 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  45.76 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  45.9 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  46.67 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  46.67 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.07 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  44.64 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  46.67 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  41.67 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  43.33 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  43.33 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  43.33 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  45 
 
 		 349 aa  50.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.07 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  40.68 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  40.68 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  40.68 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  40.68 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1918  hypothetical protein  39.66 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  42.37 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.1 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  45 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  45 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  37.29 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  43.33 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  42.37 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  43.33 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  43.33 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  42.62 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  38.33 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  45 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  37.29 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  43.33 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  37.29 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  43.33 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  37.29 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  43.33 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  43.4 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  40.98 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  43.33 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  43.33 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  39.29 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  45 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  44.64 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40.32 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  41.27 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  40.68 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  37.93 
 
 		 505 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  39.34 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  38.33 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  44.26 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  37.7 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  38.33 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  45 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  45 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  40 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  38.98 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  36.07 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7444  putative ferredoxin  49.15 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  40.68 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  33.9 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  33.9 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  37.29 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  33.9 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>