85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2478 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  87.69 
 
 
66 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  87.69 
 
 
66 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  87.69 
 
 
66 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  84.62 
 
 
66 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  53.23 
 
 
63 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  55.74 
 
 
62 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  48.39 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  46.77 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  49.18 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  49.18 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  49.18 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  44.07 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  46.55 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  43.55 
 
 
63 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  43.55 
 
 
63 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  45.31 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  44.07 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  48.33 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 
68 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.32 
 
 
68 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 
68 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  42.37 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.55 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  41.94 
 
 
63 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  38.1 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.1 
 
 
62 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  38.71 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  38.71 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8253  hypothetical protein  48.44 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  decreased coverage  0.00829105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  38.71 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  42.37 
 
 
62 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  40 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  40.62 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  40 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.38 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.83 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  36.51 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  41.27 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  45.16 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  31.82 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  35.19 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  36.67 
 
 
551 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  35.94 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  32.76 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  41.94 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  32.76 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  41.94 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  38.1 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  38.1 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  40.32 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  38.1 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  33.33 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  35.59 
 
 
101 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 
68 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  31.67 
 
 
505 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  31.03 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  37.5 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  30 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  29.03 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  32.76 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  27.42 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  27.42 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  27.42 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  35 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  31.15 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  35 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  39.34 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.81 
 
 
62 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.81 
 
 
62 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>