110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0565 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  100 
 
 		 63 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  55.74 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  55.74 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  55.74 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  57.38 
 
 		 63 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  46.03 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  49.18 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  47.62 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  43.55 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  43.33 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  43.33 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  43.33 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  43.33 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  41.94 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  46.88 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  43.55 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  43.55 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  43.55 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  40.32 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  43.55 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  45.76 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  43.75 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  44.44 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  45.31 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  44.26 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  43.55 
 
 		 551 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  32.79 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  39.34 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  38.33 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  44.26 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  44.26 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  40.74 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  40 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  34.43 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  38.71 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40.98 
 
 		 349 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  40.98 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  44.62 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  45.9 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  37.7 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  45.9 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  47.69 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.67 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  38.33 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  38.33 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  38.33 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  35.94 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  31.15 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  31.15 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  31.75 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  31.75 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  34.43 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  41.07 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  32.26 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  31.75 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  42.11 
 
 		 59 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 64 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  35.09 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  38.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  38.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  39.68 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  39.34 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  34.92 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  35.09 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  36.07 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  35.09 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  35.09 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>