138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2834 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  100 
 
 
62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  100 
 
 
62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.54 
 
 
62 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  51.61 
 
 
349 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.39 
 
 
62 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.24 
 
 
62 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.39 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.18 
 
 
62 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.24 
 
 
62 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.77 
 
 
68 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.61 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
60 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  48.39 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  48.39 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0650  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  59.68 
 
 
61 aa  58.2  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000524122  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  48.39 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
61 aa  58.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  46.77 
 
 
61 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  49.15 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  49.15 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.77 
 
 
60 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  47.62 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  47.62 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  47.62 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  47.46 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  44.44 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  40.98 
 
 
74 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  43.55 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  42.62 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  44.44 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  44.26 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  44.26 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  46.03 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  45 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  46.67 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.07 
 
 
62 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  46.67 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.76 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  38.71 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  41.67 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  41.67 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  41.67 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  38.71 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  38.33 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  41.94 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  37.7 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  41.94 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  43.55 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  40.68 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  39.34 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  37.1 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  40.98 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  43.55 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  35.48 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  38.71 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.76 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  41.94 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  39.68 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  38.71 
 
 
69 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  29.03 
 
 
76 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  38.71 
 
 
62 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  40.32 
 
 
64 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  38.33 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.27 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3764  ferredoxin  31.25 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  47.37 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  38.71 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  36.51 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  35.48 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.79 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  47.37 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  41.38 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  38.1 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  40.98 
 
 
551 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  45.45 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  38.71 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  38.33 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  30.65 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  44.64 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.87 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  31.15 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  37.1 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  34.43 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  34.43 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  34.43 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  38.1 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  40.35 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>