70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2497 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  59.68 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  55.56 
 
 		 317 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.81 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  57.14 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  59.02 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  55.74 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  54.84 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  54.84 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.23 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  49.23 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  52.38 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.69 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  52.38 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  50 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  46.15 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.19 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  46.88 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  46.88 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  46.88 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0848  ferredoxin family protein, putative  45.16 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  43.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.12 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  42.86 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.9 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  41.67 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  43.55 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  45 
 
 		 349 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.38 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  38.6 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  36.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  38.6 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  44.64 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  44.64 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  36.84 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  46 
 
 		 289 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  46 
 
 		 289 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  36.67 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  37.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  38.33 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  37.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  37.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  41.38 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  40 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5089  ferredoxin  40 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.536243  normal  0.0695219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2647  ferredoxin  40 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3764  ferredoxin  37.5 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 		 60 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  36.67 
 
 		 119 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2769  hypothetical protein  33.9 
 
 		 75 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0107  ferredoxin  38.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.8941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1749  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  34.43 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1196  hypothetical protein  34.55 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  37.04 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  36.51 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.68 
 
 		 223 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  37.93 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 		 347 aa  40  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 60 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 64 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 		 63 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>