45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1093 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  100 
 
 		 64 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  100 
 
 		 64 aa  134  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  64.52 
 
 		 63 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  62.5 
 
 		 64 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  61.29 
 
 		 63 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  59.68 
 
 		 73 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.81 
 
 		 64 aa  86.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0848  ferredoxin family protein, putative  56.45 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  57.81 
 
 		 64 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.9 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  56.25 
 
 		 63 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  58.06 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  58.62 
 
 		 317 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  54.84 
 
 		 62 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  54.84 
 
 		 62 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.23 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.16 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.16 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  40 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.28 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  38.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  40 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  38.33 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  38.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  38.33 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  40 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.61 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1570  hypothetical protein  38.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  38.98 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0286  ferredoxin II  37.88 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  36.67 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0615  3Fe-4S ferredoxin  40.68 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2057  3Fe-4S ferredoxin  40.68 
 
 		 87 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0381286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  40 
 
 		 167 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04481  3Fe-4S ferredoxin  38.33 
 
 		 126 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  35.59 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  35.59 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.55 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.7 
 
 		 63 aa  40  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>