44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0615 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0615  3Fe-4S ferredoxin  100 
 
 		 92 aa  192  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2057  3Fe-4S ferredoxin  89.66 
 
 		 87 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0381286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04481  3Fe-4S ferredoxin  72.83 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  67.05 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1570  hypothetical protein  65.91 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  67.05 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  64.77 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  69.14 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  65.52 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  65.52 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2578  hypothetical protein  76.06 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390984  normal  0.110309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  68.29 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2647  ferredoxin  65.06 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  63.64 
 
 		 156 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0107  ferredoxin  62.65 
 
 		 151 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.8941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  59.3 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  60.24 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5089  ferredoxin  64.94 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.536243  normal  0.0695219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  57.47 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_7660  predicted protein  52.38 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9697  predicted protein  55.71 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.012492  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  50 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.55 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.55 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.93 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  36.21 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  41.67 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.38 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.11 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45684  predicted protein  35.06 
 
 		 561 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  37.93 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  41.38 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.55 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  40.68 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  40.68 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  39.29 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  36.07 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  36.07 
 
 		 64 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>