38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7660 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_7660  predicted protein  100 
 
 
88 aa  186  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  58.14 
 
 
151 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  56.82 
 
 
156 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2647  ferredoxin  55.81 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668061  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  54.65 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0107  ferredoxin  53.49 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.8941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  53.49 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  50 
 
 
130 aa  94  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5089  ferredoxin  52.33 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.536243  normal  0.0695219 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  48.86 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  48.86 
 
 
139 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0615  3Fe-4S ferredoxin  52.38 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  55.56 
 
 
128 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  50 
 
 
167 aa  87.8  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2057  3Fe-4S ferredoxin  49.38 
 
 
87 aa  84.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0381286  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  47.44 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9697  predicted protein  54.41 
 
 
73 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.012492  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  49.35 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  49.35 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1570  hypothetical protein  48.05 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2578  hypothetical protein  51.43 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390984  normal  0.110309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04481  3Fe-4S ferredoxin  48.61 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45684  predicted protein  42.5 
 
 
561 aa  67  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.83 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.83 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.93 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  31.15 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 
59 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.75 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.464578  normal  0.0196074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  33.85 
 
 
317 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  34.43 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.76 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  35.48 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  30.67 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  37.5 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.21 
 
 
62 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>