62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1365 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 63 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  96.83 
 
 		 63 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  68.25 
 
 		 64 aa  98.2  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 64 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 64 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  66.67 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0848  ferredoxin family protein, putative  69.35 
 
 		 73 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  61.9 
 
 		 64 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  65.08 
 
 		 317 aa  90.1  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  61.29 
 
 		 64 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  66.67 
 
 		 63 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  61.29 
 
 		 64 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  67.74 
 
 		 62 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  64.52 
 
 		 62 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  65.08 
 
 		 63 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  63.49 
 
 		 62 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  63.49 
 
 		 62 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.06 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  52.38 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  49.21 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  48.28 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  46.55 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  46.55 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  43.1 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.19 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  41.38 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  43.1 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0615  3Fe-4S ferredoxin  44.83 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9697  predicted protein  42.62 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.012492  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.64 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  43.1 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  43.1 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0286  ferredoxin II  43.75 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.89 
 
 		 349 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2057  3Fe-4S ferredoxin  44.83 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0381286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2655  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  42.62 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  40.98 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45684  predicted protein  35.09 
 
 		 561 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0107  ferredoxin  41.38 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.8941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2647  ferredoxin  43.1 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  41.38 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.46 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5089  ferredoxin  43.1 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.536243  normal  0.0695219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 62 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  41.38 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  45.61 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04481  3Fe-4S ferredoxin  41.38 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2578  hypothetical protein  39.66 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390984  normal  0.110309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  39.13 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  41.82 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  41.82 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46 
 
 		 61 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.93 
 
 		 61 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.6 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 60 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>