98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1853 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  100 
 
 		 349 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 60 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  86.67 
 
 		 60 aa  104  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  83.33 
 
 		 60 aa  101  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  60 
 
 		 60 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.79 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  51.61 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  51.61 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.84 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.39 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.15 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.33 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  52.46 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  45.31 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  52.46 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.82 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  50.82 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.15 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  45.31 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  48.39 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.15 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  40.32 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  48.39 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  48.39 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.55 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  46.88 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  39.68 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  40.32 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.18 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  42.42 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  51.79 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  39.34 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0286  ferredoxin II  38.89 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  45 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  40.98 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  42.11 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  40.62 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  41.94 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.59 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  45 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.35 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0650  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.16 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000524122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.35 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  40.91 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  43.64 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  34.43 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  39.68 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.51 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.82 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  40.35 
 
 		 386 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 64 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  42.19 
 
 		 66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  45 
 
 		 66 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  37.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.6 
 
 		 455 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2694  hypothetical protein  45.16 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00619156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  41.67 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  40.68 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  33.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  39.34 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.8 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.11788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0923  hypothetical protein  35.94 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 		 63 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1862  ferredoxin  33.33 
 
 		 67 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0115617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>